文献类型：期刊文章

作　　者：刘畅[1] 刘思章[1] 于靖辉[1] 陈屏[1] 雷军[1] 王义[1] 张美萍[1]

LIU Chang;LIU Sizhang;YU Jinghui;CHEN Ping;LEI Jun;WANG Yi;ZHANG Meiping(Jilin Province Engineering Research Center of Ginseng Gene Resources Development and Utilization,College of Life Science,Jilin Agriculturial University,Changchun,130118,China)

机构地区：[1]吉林农业大学生命科学学院,吉林省人参基因资源开发与利用工程研究中心,吉林长春130118

出　　处：《中草药》

基　　金：吉林省科技厅项目(20180101027JC,20200403011SF);国家自然科学基金青年基金项目(31401445)。

年　　份：2024

卷　　号：55

期　　号：8

起止页码：2723-2733

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2023、CAB、CAS、CSCD、CSCD2023_2024、EMBASE、JST、RCCSE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：目的通过权重基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)挖掘人参皂苷Rh1生物合成相关基因。方法以种植于吉林省人参主产区304个农家品种的转录组测序数据为基础,以人参皂苷Rh1含量为表型进行差异表达基因的挖掘。结果通过WGCNA获得6个与人参皂苷Rh1含量密切相关的基因共表达模块,根据关联分析结果确定Green模块为与人参皂苷Rh1含量显著相关的关键模块。功能注释结果显示Green模块内的基因富集到m RNA结合、蛋白修饰等多个相关途径。通过构建基因互作网络筛选获得7个核心基因,功能预测表明这些基因可能在人参皂苷Rh1的生物合成途径中起着重要作用。对7个候选基因进行茉莉酸甲酯(methyl jasmonate,Me JA)体外调控分析。对人参不定根进行MeJA诱导处理,随Me JA的诱导,comp9517_c0_seq1、comp10896_c0_seq1、comp43180_c0_seq2、comp64014_c0_seq8的表达量与人参皂苷Rh1的含量同时呈现显著变化,但只有comp64014_c0_seq8的表达趋势与人参皂苷Rh1在Me JA诱导下的表达趋势相同,表明这条候选基因可能与人参皂苷Rh1的合成密切相关。结论为人参皂苷Rh1生物合成途径的解析提供了理论基础。

关 键 词：人参 人参皂苷RH1 差异表达基因 权重基因共表达网络分析  茉莉酸甲酯

分 类 号：R286.12[中药学类]