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文献类型:期刊文章
WANG Huizhen;ZHANG Chaozheng;HUANG Yiming;LI Yaoxin;CHENG Ziyang;YUE Chaoyin(Biotechnology Research Center,College of Biological and Pharmaceutical Sciences,China Three Gorges University,Yichang 443002,China)
机构地区:[1]三峡大学生物与制药学院,生物技术研究中心,湖北宜昌443002
基 金:农业微生物学国家重点实验室基金项目(AMLKF202205)。
年 份:2024
卷 号:39
期 号:2
起止页码:153-160
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2023、CAB、CSCD、CSCD2023_2024、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊
摘 要:为探究RPM1在高粱抗病过程中的作用,以高粱抗黑穗病品种SX44B为材料,采用同源克隆法获得一个高粱SbRPM1基因。生物信息学分析结果显示:该基因的cDNA全长2 802 bp,预测共编码933个氨基酸。该基因编码蛋白的理论分子质量为106.1 ku,等电点为7.11,为亲水性蛋白质;该蛋白无跨膜结构,亚细胞定位在细胞质中。保守结构域分析显示,SbRPM1蛋白含有RX-CC-like、NB-ARC和LRR结构域,属于NLRs受体蛋白家族中的CNL类蛋白。系统发育关系分析表明,SbRPM1蛋白与南荻RPM1蛋白亲缘关系最近。通过实时荧光定量PCR技术检测SbRPM1基因的表达模式,结果表明,该基因在叶和花序中表达量较高,其次是根,在茎中表达量最低。在接种丝黑穗病原菌后24~72 h抗病品种中SbRPM1基因的表达显著上调,表明该基因受病原菌诱导表达,在高粱抗病反应中扮演着重要角色。首次在高粱中克隆得到SbRPM1基因CDS序列,解析了该基因的结构、性质与表达的特征。
关 键 词:高粱 SbRPM1基因 基因克隆 生物信息学分析 表达分析
分 类 号:S514.03] Q78]
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引证文献:
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