文献类型：期刊文章

作　　者：陈旭[1] 储召乐[2] 秦苾珺[2] 刘碧颖[2] 李先锋[2] 王涛[2] 刘文康[2] 王斌[1,2]

CHEN Xu;CHU Zhaole;QIN Bijun;LIU Biying;LI Xianfeng;WANG Tao;LIU Wenkang;WANG Bin(Medical College of Chongqing University,Chongqing,400044;Department of Gastroenterology,Chongqing Key Laboratory of Precise Prevention and Treatment of Digestive Malignancies,Army Medical Center of PLA,Chongqing,400042,China)

机构地区：[1]重庆大学医学院,重庆400044 [2]陆军特色医学中心消化内科,消化系统肿瘤精准防治重庆市重点实验室,重庆400042

出　　处：《陆军军医大学学报》

基　　金：国家自然科学基金优秀青年科学基金(81822032);重庆市杰出青年基金(cstc2019jcyjjqx0027)。

年　　份：2024

卷　　号：46

期　　号：7

起止页码：695-704

语　　种：中文

收录情况：AJ、BDHX、BDHX2023、CAB、CAS、CSCD、CSCD2023_2024、DOAJ、RCCSE、SCOPUS、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：目的研究组蛋白H3K27ac修饰在肠型胃癌的全基因组分布情况,探讨其增强子及相关调控组重塑特征,建立临床预后评估模型。方法收集于2022年1-12月在我院消化内科就诊患者的15例肠型胃癌组织与18例正常胃黏膜组织进行靶向H3K27ac修饰的染色质靶向捕获(cleavage under targets and tagmentation,CUT&Tag)测序,采用生物信息学分析,比较两种组织H3K27ac修饰在基因组的分布差异;基于H3K27ac修饰分布特征,鉴定增强子元件,探讨增强子及相关调控组的重塑特征;采用单因素Cox和多因素Cox等回归分析方法,构建增强子相关靶基因的预后预测模型。结果两种组织的H3K27ac修饰的基因组分布特征无明显差异,主要位于增强子区域;与正常胃黏膜相比,肠型胃癌增强子H3K27ac修饰的整体水平更高;共鉴定出8847个在肠型胃癌中活性增加的增强子(获得性增强子),占所有增强子的8.3%,其可能促进胃癌细胞增殖、黏附等恶性行为;联合6个获得性增强子相关靶基因(BHLHE41、CEP97、CHI3L2、NR6A1、SUPT3H和TOMM20)构建的预测模型,能够较好地推测患者总体生存期。结论增强子重塑是肠型胃癌显著的表观遗传学特征之一,增强子可能通过上调MYC、E2F3等基因表达促进癌细胞恶性增殖与黏附行为,并基于增强子靶基因构建预后模型。

关 键 词：肠型胃癌 表观基因组学  H3K27ac  增强子 预后

分 类 号：R318.04[生物医学工程类] R394.3[基础医学类] R735.2