文献类型：期刊文章

作　　者：秦苾珺[1] 谭玉婷[2,3] 储召乐[2] 刘碧颖[2] 李先锋[2] 王涛[2] 陈东风[2] 崔红娟[1] 吴林育[2] 王斌[2]

QIN Bijun;TAN Yuting;CHU Zhaole;LIU Biying;LI Xianfeng;WANG Tao;CHEN Dongfeng;CUI Hongjuan;WU Linyu;WANG Bin(Southwest University Medical Research Institute,Chongqing,400715;Department of Gastroenterology,Chongqing Key Laboratory of Precision Diagnosis and Treatment for Digestive Malignancies,Army Medical Center of PLA(Daping Hospital),Army Medical University(Third Military Medical University),Chongqing,400042;School of Medicine,Chongqing University,Chongqing,400044,China)

机构地区：[1]西南大学医学研究院,重庆400715 [2]陆军军医大学陆军特色医学中心(大坪医院)消化内科,消化系统肿瘤精准防治重庆市重点实验室,重庆400042 [3]重庆大学医学院,重庆400044

出　　处：《陆军军医大学学报》

基　　金：国家自然科学基金资助项目(81822032,91959111,81872027);重庆市自然科学基金项目(cstc2019jcyjjqX0027,cstc2021jcyj-msxmX0340)。

年　　份：2024

卷　　号：46

期　　号：6

起止页码：597-607

语　　种：中文

收录情况：AJ、BDHX、BDHX2023、CAB、CAS、CSCD、CSCD2023_2024、DOAJ、JST、RCCSE、SCOPUS、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：目的 绘制胃黏膜高级别上皮内瘤变(High-Grade Intraepithelial Neoplasia, HGIN)组织的组蛋白H3K27me3沉默子图谱,寻找沉默子调控的重要靶基因。方法 从本院内镜中心收集HGIN与正常胃黏膜组织各24例,采用H3K27me3染色体靶向切割和标签化(Cleavage Under Target&Tagmentation, CUT&Tag)测序技术捕获基因组修饰区域。通过生物信息学分析比较两类组织的沉默子信号特征以及差异;整合RNA测序数据及高通量染色体构象捕获技术(Hi-C)公共数据,分析沉默子重塑调控的靶基因及调控的潜在生物学过程。结果 与正常胃黏膜相比,HGIN组织H3K27me3修饰数量减少,信号强度全局性降低,呈现H3K27me3信号峰重塑现象;转录组差异分析结果显示,与正常胃黏膜组织相比,HGIN共有8 887个差异表达基因,其中表达上调基因4 335个,表达下调基因4 552个,其中CTNNB1等肿瘤发生相关基因显著上调;整合分析表观组学和转录组学数据,发现沉默子丢失可能在转录水平上调氨基酸生物合成、精氨酸与脯氨酸代谢和糖酵解等关键代谢基因,如糖酵解关键酶磷酸甘油醛激酶1(phosphoglycerate kinase1,PGK1)表达,进而促进胃黏膜上皮内瘤变。结论 组蛋白H3K27me3沉默子信号丢失是HGIN表观重塑特征之一,沉默子丢失可能与PGK1等糖酵解和氨基酸代谢基因表达紊乱相关。

关 键 词：胃高级别上皮内瘤变  胃癌  组蛋白修饰H3K27me3  沉默子 磷酸甘油醛激酶1  

分 类 号：R394.3] R730.23[基础医学类] R735.2