文献类型：期刊文章

作　　者：闫超凡[1] 孙雪梅[1] 钟启文[1] 邵登魁[1] 邓昌蓉[1] 文军琴[1]

YAN Chaofan;SUN Xuemei;ZHONG Qiwen;SHAO Dengkui;DENG Changrong;WEN Junqin(Qinghai Key Laboratory of Vegetable Genetics and Physiology,Laboratory for research and Utilization of Germplasm Resources in Qinghai Tibet Plateau,Institute of Horticulture,Academy of Agriculture and Forestry,Qinghai University,Xining 810016,China)

机构地区：[1]青海大学农林科学院园艺研究所,青海省蔬菜遗传与生理重点实验室,青藏高原种质资源研究与利用实验室,西宁810016

出　　处：《园艺学报》

基　　金：青海省自然科学基金(青年)项目(2023-ZJ-953Q);国家重点研发项目(2022YFD1602400)。

年　　份：2024

卷　　号：51

期　　号：2

起止页码：266-280

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2023、CAB、CAS、CSCD、CSCD2023_2024、EAPJ、JST、RCCSE、SCOPUS、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：20S蛋白酶体能够通过自身或泛素—蛋白酶体系统特异性降解细胞质和细胞核中的蛋白质,维持细胞蛋白质稳态。本研究中鉴定出21个番茄(Solanum lycopersicum L.)20S蛋白酶体基因家族成员,并对其进行生物信息分析。结果表明,番茄20S蛋白酶体大多数基因含有相似的启动子和内含子,其中,编码α亚基的基因保守性较好,而编码β亚基的基因保守性较差;亚细胞定位发现,绝大多数基因在细胞质中发挥功能;染色体定位和基因复制分析发现,21个20S蛋白酶体基因不均匀地分布在12条染色体上,存在2对片段复制基因对;进化分析表明,编码α亚基和编码β亚基的基因被划分在不同的类群或亚群;多物种共线性分析发现,番茄与辣椒(Capsicum annuum L.)和马铃薯(Solanum tuberosum L.)之间的同源基因对较多,而与拟南芥[Arabidopsis thaliana(L.)Heynh.]、水稻(Oryza sativa L.)和玉米(Zea mays L.)同源的基因对较少。SlPRA1-01、SlPRA10-04、SlPRA11-05和SlPRA16-09这4个基因在3个物种中均形成基因对;启动子和组织特异性表达分析结果显示,20S蛋白酶体基因家族在番茄逆境胁迫和生长发育中发挥着重要作用。

关 键 词：番茄 20S蛋白酶体  泛素—蛋白酶体系统  生物信息分析

分 类 号：S641.2]