期刊文章详细信息
出芽短梗霉菌株PA-2胁迫下藜qRT-PCR内参基因的筛选与验证
Screening and Validation of qRT-PCR Reference Genes in Chenopodium album under the Stress of Aureobasidium pullulans PA-2
文献类型:期刊文章
LIU Xiaofang;CHENG Liang;GUO Qingyun(Institute of Plant Protection,Qinghai Academy of Agriculture and Forestry Science,Qinghai University/Key Laboratory of Integrated Management of Agricultural Pests in Qinghai Province/Xining Crop PestScientific Observation and Experimental Station,Ministry of Agriculture and Rural Affairs,Xining810016,China)
机构地区:[1]青海大学农林科学院植物保护研究所/青海省农业有害生物综合治理重点实验室/农业农村部西宁作物有害生物科学观测实验站,青海西宁810016
基 金:青海省自然科学基金面上项目(2022-ZJ-911);国家自然科学基金项目(31760539);青海省农业有害生物综合治理重点实验室项目(2022-ZJ-Y10)资助。
年 份:2024
卷 号:46
期 号:2
起止页码:48-56
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2023、CAB、CSCD、CSCD2023_2024、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊
摘 要:为筛选适合出芽短梗霉菌株PA-2胁迫下藜中稳定表达的内参基因,在转录组数据(NCBI登录号为:SRA:SRR12674257)分析的基础上,以PA-2不同时间胁迫的藜叶片为材料,分析藜中ACT-1、TUB-1、GAPDH、eEF1α、eIF3、UBQ、PTB、COX10、UPL6、TIP41L、RAN-B1和IDH-5等12个内参基因的表达水平,并利用ΔCt、GeNorm、NormFinder、BestKeeper及RefFinder分析候选内参基因的表达稳定性。结果表明,内参基因COX10是PA-2不同时间胁迫下藜中最稳定的内参基因,最优组合是COX10+eEF1α。通过分析藜ACC基因的相对表达水平,验证了内参基因的可靠性,为今后杂草藜胁迫响应基因的表达分析提供了参考基因和理论依据。
关 键 词:出芽短梗霉菌株PA-2 QRT-PCR 藜 内参基因 表达稳定性
分 类 号:S451]
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