文献类型：期刊文章

作　　者：张进[1] 邓永彪[1] 赵博[1]

ZHANG Jin;DENG Yongbiao;ZHAO Bo(Department of Pharmacognosy,Pharmacy School,Guilin Medical University,Guilin 541199,Guangxi,China)

机构地区：[1]桂林医学院药学院生药学教研室,广西桂林541199

出　　处：《生物工程学报》

基　　金：国家自然科学基金(32060090);广西壮族自治区自然科学基金(2021JJA130119);广西研究生教育创新计划(YCSW2023414)。

年　　份：2024

卷　　号：40

期　　号：1

起止页码：280-291

语　　种：中文

收录情况：AJ、BDHX、BDHX2023、CAS、CSCD、CSCD2023_2024、EAPJ、EMBASE、JST、RCCSE、SCOPUS、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：本研究通过高通量测序技术对越南金花茶(Camellia insularis Orel&Curry)的叶绿体(chloroplast,cp)基因组进行了测序。结果显示,越南金花茶叶绿体基因组长度为156882bp,包含132个基因,其中,88个编码蛋白质,36个编码tRNA,8个编码rRNA。密码子偏好性分析显示,编码亮氨酸的密码子数量最多,且第三位密码子显示出了较高的A/U偏好。此外,共鉴定出了67个简单重复序列(simple sequence repeats,SSR),发现越南金花茶SSR偏好使用A和T碱基。除了少数可变区域之外,越南金花茶与其近缘物种的叶绿体基因组反向重复(inverted repeat,IR)边界区域相当保守。系统发育分析表明,越南金花茶与云南金花茶(Camellia fascicularis)亲缘关系最近。金花茶是基因工程培育黄色山茶花的重要材料,本研究为叶绿体工程提供了基本的遗传信息,为深入研究金花茶组植物的进化、物种鉴定和基因组育种研究提供了宝贵的资源。

关 键 词：越南金花茶  叶绿体基因组 结构特征 系统发育分析

分 类 号：S685.14]