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不同核数的灵芝菌丝体转录组比较分析
Comparative analysis of transcriptome of Ganoderma lucidum mycelium with different nuclear numbers
文献类型:期刊文章
WANG Hong-li;YANG Yang;HU Xue-bo(College of Plant Science and Technology/Institute of Medicinal Plants/Innovation China&the Belt and Road International Institute for Industrial Science and Technology Innovation of Traditional Chinese Medicinal Materials/National and Local Joint Engineering Research Center for Medicinal Plant Breeding and Cultivation/Hubei Engineering Research Center for Medicinal Plants,Huazhong Agricultural University,Wuhan 430070,China)
机构地区:[1]华中农业大学植物科学技术学院/药用植物研究所/“科创中国”“一带一路”国际中药材科技产业创新院/药用植物繁育与栽培国家地方联合工程研究中心/药用植物湖北省工程研究中心,武汉430070
基 金:湖北省科技创新人才及服务专项(2022EHB047);湖北省农业科技创新中心道地药材安全高效生产关键技术研究与示范项目(2020-620-000-002-04)。
年 份:2023
卷 号:62
期 号:12
起止页码:200-205
语 种:中文
收录情况:JST、ZGKJHX、普通刊
摘 要:以野生灵芝[Ganoderma lucidum(Leyss. ex Fr.)Karst.](D)、自然单核灵芝(Mo)、双核灵芝(Mu)的菌丝体为材料,利用高通量测序技术筛选差异表达基因,并进行GO分析和KEGG富集分析。通过差异基因分析,筛选出568个差异表达基因。GO分析结果表明,野生灵芝(D)与自然单核灵芝(Mo)菌丝体的差异表达基因主要富集在转录调控及DNA模板化、tRNA氨酰化、组蛋白甲基化等过程;野生灵芝(D)与双核灵芝(Mu)菌丝体的差异表达基因主要富集在染色质沉默、L-丝氨酸代谢、硫化合物代谢等过程;自然单核灵芝(Mo)与双核灵芝(Mu)菌丝体的差异表达基因主要富集在染色质沉默、DNA模板转录、谷氨酸分解等过程。KEGG富集结果表明,自然单核灵芝(Mo)与双核灵芝(Mu)菌丝体在代谢通路上有明显的差异,差异基因主要被注释到过氧化物酶、维生素代谢等通路。野生灵芝(D)与自然单核灵芝(Mo)菌丝体、野生灵芝(D)与双核灵芝(Mu)菌丝体的差异基因并没有KEGG富集的结果,说明其代谢通路没有明显差异。筛选出3个品系中表达量差异均显著的基因,共12个,并对基因的主要功能进行预测。12个基因中有5个基因可以匹配到GO库。GO注释结果表明,这5个基因主要被注释到氧化还原酶活性、金属离子结合、膜的调控与膜组成等方面。
关 键 词:灵芝[Ganoderma lucidum(Leyss.ex Fr.)Karst.] 转录组 菌丝体核数
分 类 号:S567.3]
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