文献类型：期刊文章

作　　者：刘京[1,2] 李晶[2] 杨澜[2] 管珊珊[2] 魏以梁[3] 赵雯婷[2] 江丽[2] 赵东[1] 李彩霞[2]

LIU Jing;LI Jing;YANG Lan;GUAN Shan-Shan;WEI Yi-Liang;ZHAO Wen-Ting;JIANG Li;ZHAO Dong;LI Cai-Xia(Key Laboratory of Evidence Science,Ministry of Education,China University of Political Science and Law,Beijing 100088,China;Key Laboratory of Forensic Genetics,Ministry of Public Security,National Engineering Laboratory for Forensic Science,Institute of Forensic Science,Beijing 100038,China;Jiangsu Key Laboratory of Phylogenomics and Comparative Genomics,School of Life Sciences,Jiangsu Normal University,Xuzhou 221116,China)

机构地区：[1]中国政法大学,证据科学教育部重点实验室,北京100088 [2]公安部鉴定中心,法医遗传学公安部重点实验室,现场物证溯源技术国家工程实验室,北京100038 [3]江苏师范大学生命科学学院,江苏省系统发育与比较基因组学重点实验室,徐州221116

出　　处：《生物化学与生物物理进展》

基　　金：国家自然科学基金(82171870);公安部技术研究计划(2021JSZ15);中央级公益性科研院所基本科研业务费(2021JB004)资助项目。

年　　份：2023

卷　　号：50

期　　号：12

起止页码：2980-2990

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2020、CSCD、CSCD2023_2024、IC、JST、RCCSE、SCIE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：目的研究构建基于共祖(identity-by-descent,IBD)片段算法预测远亲缘关系分析流程并评估预测准确性。方法采用高密度单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)芯片对253份家系样本进行检测,研究基于IBD片段算法的分析流程进行两两个体间亲缘关系预测,评估预测准确性。随机减少SNP位点,评估位点数对算法预测准确性的影响。结果IBD片段算法预测1~7级亲缘关系平均置信区间准确率为94.72%,预测可信度为99.77%,6级及以上亲缘关系预测时出现假阴性。随着SNP数量减少,预测准确性会出现一定程度的下降。结论IBD片段算法可用于7级以内亲缘关系的预测,该算法在群体遗传学、法医遗传学等领域有重要应用价值。

关 键 词：共祖片段算法  法医系谱推断  远亲缘关系预测  

分 类 号：R89[法医学类] Q812[临床医学类]