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期刊文章详细信息

人参皂苷生物合成相关基因PgRg_(2)BBE克隆及生物信息学分析    

Cloning and Bioinformatics Analysis of PgRg_(2)BBE Gene in Panax ginseng Rg_(2) Biosynthesis

  

文献类型:期刊文章

作  者:李傲[1] 刘思章[1] 王义[1] 王康宇[1] 朱蕾[1] 李俐[1] 姜悦[1] 王艳芳[2]

LI Ao;LIU Sizhang;WANG Yi;WANG Kangyu;ZHU Lei;LI Li;JIANG Yue;WANG Yanfang(College of Life Sciences,Jilin Province Engineering Research Center for Ginseng Genetic Resources Development and Utilization,Jilin Agricultural University,Changchun 130118,China;Labora-tory for Cultivation and Breeding of Medicinal Plants of National Administrition of Traditional Chi-nese Medicine,Jilin Agricultural University,Changchun,130118,China)

机构地区:[1]吉林农业大学生命科学学院,吉林省人参基因资源开发与利用工程研究中心,长春130118 [2]吉林农业大学国家中医药管理局药用植物栽培育种三级实验室,长春130118

出  处:《吉林农业大学学报》

基  金:吉林省科技发展计划项目(20180101027JC,20200403011SF,20210204063YY);吉林省教育厅“十三五”科学技术项目(JJKH20170310KJ);国家自然科学基金青年基金项目(31401445)。

年  份:2023

卷  号:45

期  号:6

起止页码:693-701

语  种:中文

收录情况:BDHX、BDHX2020、CAB、CSCD、CSCD_E2023_2024、JST、RCCSE、WOS、ZGKJHX、核心刊

摘  要:克隆与人参皂苷Rg_(2)合成相关的重要酶基因PgRg_(2)BBE全长cDNA序列,并利用在线软件对该基因编码的蛋白质进行理化性质、结构域、亚细胞定位和系统进化等分析。结果表明:PgRg_(2)BBE基因cDNA序列长为1638 bp,编码545个氨基酸。PgRg_(2)BBE蛋白分子量为60967.10 u,等电点为8.88,不稳定性指数为34.04,预测该蛋白为一种稳定的亲水性跨膜蛋白,主要由α-螺旋和无规则卷曲组成。PgRg_(2)BBE蛋白含有FAD_binding_4和BBE功能结构域,定位于叶绿体中,含有24个氨基酸序列信号肽。系统发育树分析发现,其与智利茄的亲缘关系最近,氨基酸序列多重比对发现,RgRg_(2)BBE中含有4个保守基序,进一步与拟南芥AtBBE家族蛋白进行同源序列比对,发现它们同时具有4个保守基序(RKYGL、MGED、FWAIRGG、FPEI)。

关 键 词:人参皂苷Rg_(2)  生物合成 PgRg_(2)BBE  基因克隆  生物信息学 序列分析  

分 类 号:S567.51] R284.3]

参考文献:

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同被引文献:

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