期刊文章详细信息
人参皂苷生物合成相关基因PgRg_(2)BBE克隆及生物信息学分析
Cloning and Bioinformatics Analysis of PgRg_(2)BBE Gene in Panax ginseng Rg_(2) Biosynthesis
文献类型:期刊文章
LI Ao;LIU Sizhang;WANG Yi;WANG Kangyu;ZHU Lei;LI Li;JIANG Yue;WANG Yanfang(College of Life Sciences,Jilin Province Engineering Research Center for Ginseng Genetic Resources Development and Utilization,Jilin Agricultural University,Changchun 130118,China;Labora-tory for Cultivation and Breeding of Medicinal Plants of National Administrition of Traditional Chi-nese Medicine,Jilin Agricultural University,Changchun,130118,China)
机构地区:[1]吉林农业大学生命科学学院,吉林省人参基因资源开发与利用工程研究中心,长春130118 [2]吉林农业大学国家中医药管理局药用植物栽培育种三级实验室,长春130118
基 金:吉林省科技发展计划项目(20180101027JC,20200403011SF,20210204063YY);吉林省教育厅“十三五”科学技术项目(JJKH20170310KJ);国家自然科学基金青年基金项目(31401445)。
年 份:2023
卷 号:45
期 号:6
起止页码:693-701
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2020、CAB、CSCD、CSCD_E2023_2024、JST、RCCSE、WOS、ZGKJHX、核心刊
摘 要:克隆与人参皂苷Rg_(2)合成相关的重要酶基因PgRg_(2)BBE全长cDNA序列,并利用在线软件对该基因编码的蛋白质进行理化性质、结构域、亚细胞定位和系统进化等分析。结果表明:PgRg_(2)BBE基因cDNA序列长为1638 bp,编码545个氨基酸。PgRg_(2)BBE蛋白分子量为60967.10 u,等电点为8.88,不稳定性指数为34.04,预测该蛋白为一种稳定的亲水性跨膜蛋白,主要由α-螺旋和无规则卷曲组成。PgRg_(2)BBE蛋白含有FAD_binding_4和BBE功能结构域,定位于叶绿体中,含有24个氨基酸序列信号肽。系统发育树分析发现,其与智利茄的亲缘关系最近,氨基酸序列多重比对发现,RgRg_(2)BBE中含有4个保守基序,进一步与拟南芥AtBBE家族蛋白进行同源序列比对,发现它们同时具有4个保守基序(RKYGL、MGED、FWAIRGG、FPEI)。
关 键 词:人参皂苷Rg_(2) 生物合成 PgRg_(2)BBE 基因克隆 生物信息学 序列分析
分 类 号:S567.51] R284.3]
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