文献类型：期刊文章

作　　者：袁超[1] 练庆海[2] 尼贝贝[2] 许燕[3] 张彤[1] 张剑[1]

Yuan Chao;Lian Qinghai;Ni Beibei;Xu Yan;Zhang Tong;Zhang Jian(不详;Department of Hepatic Surgery,Liver Transplantation Center,the Third Affiliated Hospital of Sun Yat-sen University,Guangzhou 510630,China)

机构地区：[1]中山大学附属第三医院肝脏外科暨肝移植中心,广州510630 [2]中山大学附属第三医院疫苗研究所,广州510630 [3]中山大学附属第三医院生物治疗中心,广州510630

出　　处：《器官移植》

基　　金：广东省自然科学基金面上项目(2019A1515011850、2022A1515012224)。

年　　份：2024

卷　　号：15

期　　号：1

起止页码：90-101

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2023、CSCD、CSCD2023_2024、EMBASE、JST、RCCSE、UPD、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：目的筛选酒精性肝炎(AH)的自噬关键基因,探讨AH潜在的生物标志物和治疗靶点。方法采用基因表达综合数据库(GEO)中的2个AH基因芯片和从MSigDB、GeneCards数据库中获得的自噬相关数据集,通过加权基因共表达网络分析(WGCNA)获取关键基因。对筛选的关键基因进行基因本体(GO)、京都基因和基因组百科全书(KEGG)功能富集分析,蛋白质相互作用(PPI)分析,免疫浸润分析,构建信使RNA(mRNA)-微小RNA(miRNA)网络,进行酒精性肝病不同分期的自噬相关关键基因的表达差异分析,并进一步通过实时荧光定量逆转录聚合酶链反应(RT-qPCR)在AH患者和小鼠肝脏组织中验证。结果本研究筛选得到了11个与AH自噬相关的基因(EEF1A2、CFTR、SOX4、TREM2、CTHRC1、HSPB8、TUBB3、PRKAA2、RNASE1、MTCL1、HGF),均为上调基因。在AH患者和小鼠肝脏组织中,SOX4、TREM2、HSPB8、PRKAA2在AH组中的相对表达量均高于对照组。结论SOX4、TREM2、HSPB8、PRKAA2可能是AH潜在的生物标志物和治疗靶点。

关 键 词：酒精性肝炎 自噬 关键基因 生物信息学  加权基因共表达网络分析(WGCNA)  基因本体(GO)  京都基因和基因组百科全书(KEGG)  蛋白质相互作用(PPI)  

分 类 号：R617] R318.04[临床医学类]