文献类型：期刊文章

作　　者：郭彬瀚[1,2] 叶萍[1,2] 陈剑[1,2] 凤婧[1,2] 江咏梅[1,2]

GUO Binhan;YE Ping;CHEN Jian(Department of Laboratory Medicine,West China Second University Hospital,Sichuan University,Chengdu 610041)

机构地区：[1]四川大学华西第二医院医学检验科,610041 [2]出生缺陷与相关妇儿疾病教育部重点实验室(四川大学),610041

出　　处：《临床输血与检验》

年　　份：2023

卷　　号：25

期　　号：6

起止页码：789-797

语　　种：中文

收录情况：CAS、JST、ZGKJHX、普通刊

摘　　要：目的miRNA主要通过基因沉默参与基因表达的转录后调控。本研究基于生物信息学分析推测,临床输血治疗中不同储存时间红细胞中含有的miRNA通过靶基因及其介导的分子信号通路在肿瘤进展和预后中发挥着潜在的影响。方法通过基因表达综合数据库(gene expression omnibus,GEO)以及癌症基因组图谱数据库(the cancer genome atlas,TCGA)筛选差异表达的miRNAs(DEmiRNAs)和mRNAs(DEmRNAs)。通过对miRNA靶基因进行通路富集分析,并与DEmRNAs进行整合后,筛选出候选基因,建立风险因子预测模型,通过生存分析及ROC曲线评估模型可靠性。结果相较于GSE114990数据集中储存第1天,第7天和第28天数据分别鉴定出27和22个DEmiRNAs。经过筛选、预测以及整合分析,选择miR-381及其候选18个靶基因构建风险因子预测模型,揭示了不同风险组之间生存率的显著差异,并鉴定出miR-381-靶基因(NR 3C 1、TSHZ 3、LIPG和DLC 1)-肿瘤的潜在分子信号通路。结论本研究结果表明,在接受不同储存时间红细胞的子宫内膜癌患者中,基于“miR-381-靶基因-肿瘤”信号轴的的潜在分子机制可能会影响疾病的进展和预后。

关 键 词：MIRNA MRNA 输血 肿瘤  生物信息学

分 类 号：R457]