文献类型：期刊文章

作　　者：马楚涵[1] 孙家琰[2] 赵雨馨[3] 赵幼敏[3] 刘奕墨[4] 赵子涵[1] 王子剑[1] 尹智华[3]

MA Chuhan;SUN Jiayan;ZHAO Yuxin;ZHAO Youmin;LIU Yimo;ZHAO Zihan;WANG Zijian;YIN Zhihua(First Clinical College,China Medical University,Shenyang,Liaoning 110122,China;Fourth Clinical College,China Medical University,Shenyang,Liaoning 110122,China;School of Public Health,China Medical University,Shenyang,Liaoning 110122,China;School of Health Management,China Medical University,Shenyang,Liaoning 110122,China)

机构地区：[1]中国医科大学第一临床学院,辽宁沈阳110122 [2]中国医科大学第四临床学院,辽宁沈阳110122 [3]中国医科大学公共卫生学院,辽宁沈阳110122 [4]中国医科大学健康管理学院,辽宁沈阳110122

出　　处：《国际检验医学杂志》

基　　金：国家级大学生创新创业计划训练项目(202210159003)。

年　　份：2023

卷　　号：44

期　　号：24

起止页码：2954-2962

语　　种：中文

收录情况：CAS、IC、JST、RCCSE、ZGKJHX、普通刊

摘　　要：目的筛选肺腺癌上皮间质转化(EMT)相关基因,并对其进行功能富集分析及蛋白互作网络(PPI)构建,根据竞争性内源RNA(ceRNA)假说及基因表达对患者预后的影响构建ceRNA网络。方法利用基因表达图谱及肿瘤基因组图谱数据库筛选肺腺癌组织与正常组织的差异表达基因,将其导入GenClip3,得到EMT相关基因;应用Metascape对其进行基因本体论及京都基因和基因组百科全书富集分析,并且通过STRING数据库构建PPI并获得EMT关键基因;利用Kaplan-Meier分析关键基因与患者预后的关系;使用miRTarbase、miRNet database、ENCORI等分析工具构建ceRNA网络。结果本研究获得了156个肺腺癌EMT相关基因及其关键基因钙黏蛋白1、白细胞介素-6、基质金属蛋白酶9、血小板内皮细胞黏附分子、细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂2A、α1-Ⅰ型胶原基因、分泌型磷酸蛋白1、TIMP基质金属蛋白酶抑制因子1、小窝蛋白1、zeste基因增强子同源物2(EZH2),并预测了关键基因的PPI及共同靶向这些关键基因的治疗性中药丹参、人参芦、人参、人参叶、人参花;构建了EZH2/hsa-miR-101-3p/GSEC预后相关ceRNA调控网络。结论本研究利用生物信息学方法系统描述了EMT过程中的基因相互作用,根据肺腺癌患者临床数据构建了EMT过程的预后相关ceRNA网络,为肺腺癌的治疗和预后判断提供了新思路。

关 键 词：上皮间质转化 关键基因 竞争性内源RNA  

分 类 号：R734.2]