文献类型：期刊文章

作　　者：何佳琪[1] 崔馨桐[2] 王建乔[2] 李倩[2] 赵钰佳[2] 侯晓雯[3] 冯旭[3] 吴际[4]

HE Jiaqi;CUI Xintong;WANG Jianqiao;LI Qian;ZHAO Yujia;HOU Xiaowen;FENG Xu;WU Ji(Undergraduate of School of Stomatology,Shenyang Medical College,Shenyang 110034,China;Postgraduate of Shenyang Medical College,Shenyang Medical College,Shenyang 110034,China;Department of Health Statistics,Shenyang Medical College,Shenyang 110034,China;Shenyang Medical College,Shenyang Medical College,Shenyang 110034,China)

机构地区：[1]沈阳医学院口腔医学院,辽宁沈阳110034 [2]沈阳医学院公共卫生学院,辽宁沈阳110034 [3]沈阳医学院公共卫生学院卫生统计学教研室,辽宁沈阳110034 [4]沈阳医学院沈阳医学院,辽宁沈阳110034

出　　处：《沈阳医学院学报》

基　　金：沈阳医学院大学生科研项目(No.20219029);沈阳医学院硕士研究生科技创新基金项目(No.Y20220521)。

年　　份：2023

卷　　号：25

期　　号：6

起止页码：649-653

语　　种：中文

收录情况：JST、普通刊

摘　　要：目的:筛选结直肠癌相关的lncRNA,构建lncRNA-miRNA-mRNA竞争性内源网络,并预测其生物学功能。方法:从GEO数据库下载结直肠癌表达谱芯片数据并进行差异分析,使用Cytoscape软件构建ceRNA调控网络,利用DAVID对差异基因进行基因本体论(GO)功能和京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,使用GEPIA数据库验证差异表达lncRNA与结直肠癌患者预后的关系。结果:从GEO数据库下载芯片GSE156720、GSE126092、GSE156732和GSE134834,筛选出差异表达基因,构建了基于4个lncRNA(HAND2-AS1、MEF2C-AS1、LINC01354和CRNDE)的ceRNA调控网络。GO、KEGG以及蛋白质互作分析结果显示这4个lncRNA可能通过竞争性结合miRNA,参与到结直肠癌的发生发展过程,其中HAND2-AS1与结直肠癌患者预后有关(P<0.05)。结论:通过生物信息学方法构建了结直肠癌lncRNA相关的ceRNA调控网络,为研究结直肠癌的分子机制研究提供了参考。

关 键 词：长链非编码RNA GEO数据库  竞争性内源RNA  结直肠癌

分 类 号：R735.34]