期刊文章详细信息
不同养殖密度虹鳟幼鱼生长和肌肉转录组比较分析
Comparative Analysis of the Growth and Muscle Transcriptome of Juvenile Rainbow Trout Oncorhynchus mykiss under Different Culture Densities
文献类型:期刊文章
ZHU Minjie;ZENG Qi;CHENG Chao;XIAO Min;LI Aiping;JIAN Shaoqing;ZHAO Daxian(School of Life Sciences,Nanchang University,Jiangxi Aquatic Animal Resources and Utilization Key Laboratory,Nanchang 330031,China;Jinggangshan Agricultural Science and Technology Park,Ji’an 343000,China;Jinggangshan Zhulaozong Cold Water Fish Specialized Breeding Cooperative,Ji’an 343000,China)
机构地区:[1]南昌大学生命科学学院,江西省水产动物资源与利用重点实验室,江西南昌330031 [2]井冈山农业科技园,江西吉安343000 [3]井冈山市竹佬总冷水鱼养殖专业合作社,江西吉安343000
基 金:国家重点研发计划“蓝色粮仓科技创新”专项(2018YFD0901704);江西省现代农业产业技术体系专项(JXARS-03)。
年 份:2023
卷 号:42
期 号:5
起止页码:747-759
语 种:中文
收录情况:AJ、BDHX、BDHX2020、CAB、CAS、CSCD、CSCD_E2023_2024、IC、JST、RCCSE、WOS、ZGKJHX、核心刊
摘 要:为探明养殖密度对虹鳟幼鱼生长性能的影响,对高密度(6.99 kg/m^(3))、中密度(4.66 kg/m^(3))、低密度(2.33 kg/m^(3))养殖条件下虹鳟生长和肌肉转录组进行比较分析。试验结果显示:养殖32 d后,低密度组终末体质量等指标均高于中、高密度组;每个样品转录组有效数据均达5.99 Gb,比对效率91.67%~92.77%,共发掘5501个新基因,其中4121个得到注释,1380个未得到注释;低密度组与高密度组、低密度组与中密度组、中密度组与高密度组比较分别获得了2760、654、2316个差异表达基因,其生物学过程和细胞组分均富集在DNA整合、DNA介导的转位和褶皱,分子功能主要富集在细胞骨架的结构组成(低密度组与高密度组、中密度组与高密度组差异表达基因)和DNA结合、氧化还原酶活性作用于成对供体结合或重组(低密度组与中密度组差异表达基因),且分别有920、196、743个差异表达基因定位到相应的212、112、189个特定代谢途径;通过人工筛选获得了19条与生长和应激相关的基因序列。试验结果表明,养殖密度对虹鳟幼鱼生长及相关基因的表达产生显著影响。
关 键 词:虹鳟 养殖密度 生长 转录组 比较分析
分 类 号:S917.4[水产类]
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