文献类型：期刊文章

作　　者：刘颖[1] 李萌萌[1] 白莉[1]

LIU Ying;LI Meng-meng;BAI Li(Department of Pathogenic Biology and Immunology,Kangda College of Nanjing Medical University,Lianyungang 222000,China)

机构地区：[1]南京医科大学康达学院病原生物学与免疫学教研室,江苏连云港222000

出　　处：《生物技术》

基　　金：南京医科大学康达学院科研发展基金项目(KD2021KYJJZD108)。

年　　份：2023

卷　　号：33

期　　号：3

起止页码：301-304

语　　种：中文

收录情况：CAS、JST、ZGKJHX、普通刊

摘　　要：[目的]对人NOD2蛋白进行生物信息学分析,预测其结构和功能,为儿童癫痫与肠道菌群之间的关系提供试验基础。[方法]利用生物信息学工具对人NOD2蛋白的理化性质、亲/疏水性、跨膜区域、空间结构、亚细胞定位、信号肽、磷酸化位点进行预测。[结果]人NOD2蛋白由1013个氨基酸残基组成,相对分子质量112530.04 Da,等电点为6.59,分子式为C_(5033)H_(7960)N_(1402)O_(1428)S_(49),带负电荷的残基总数(天冬氨酸+谷氨酸)103个,带正电荷的残基总数(精氨酸+赖氨酸)96个,蛋白不稳定系数为48.75,脂肪系数为101.46,总平均亲水性系数为0.008。二级结构由54.59%的α-螺旋、10.07%的延伸链、5.73%的β-转角、29.62%的无规卷曲构成。亚细胞被确认为定位在细胞膜、细胞质和线粒体中。[结论]人NOD2蛋白是一种不含信号肽和跨膜区的疏水性蛋白,具有激酶活性。该研究为探讨儿童癫痫与肠道菌群及炎症之间的关系提供了依据。

关 键 词：人NOD2蛋白  儿童癫痫 肠道菌群 炎症 生物信息学分析

分 类 号：R34[基础医学类] Q39]