文献类型：期刊文章

作　　者：陈双扣[1] 唐思[1] 谭小庆[1] 徐曦[1] 任风鸣[2] 管天冰[1] 孙静怡[1] 胡新龙[1]

CHEN Shuang-kou;TANG Si;TAN Xiao-qing;XU Xi;REN Feng-ming;GUAN Tian-bing;SUN Jing-yi;HU Xin-long(Department of chemistry and chemical engineering,Chongqing University of Science and Technology,Chongqing 401331,China;Institute of Medicinal Plant Cultivation,Chongqing 408435,China)

机构地区：[1]重庆科技学院化学化工学院,重庆401331 [2]重庆市药物种植研究所,重庆408435

出　　处：《化学研究与应用》

基　　金：重庆英才计划-创新创业示范团队项目(CQYC20210309793)资助;重庆英才计划-基础研究与前沿探索项目(cstc2022ycjhbgzxm0029)资助。

年　　份：2023

卷　　号：35

期　　号：7

起止页码：1624-1634

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2020、CAS、JST、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：铜绿假单胞菌是引起宿主防御机制受损患者严重感染的重要原因。胞外酶S(exoS)为铜绿假单胞菌III型分泌系统(T3SS)分泌的毒力因子之一,是维持细菌在宿主体内繁殖的重要步骤。因此,本文首先运用虚拟筛选的方法学研究,确定exoS的6GNJ靶点蛋白为应用于分子对接虚拟筛选的最佳对接模型。随后利用分子对接、结构相似性筛选和类药性评价等多种策略,从中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)数据库中筛选出4个命中分子。分子对接显示MOL008550和MOL001870与exoS受体蛋白具有强氢键作用和疏水相互作用,表现出较高的结合亲和力,为前2位最佳命中分子。结合分子动力学模拟分析发现,MOL008550和MOL001870与exoS受体蛋白的复合物比参考化合物(F4W501)具有更有利的动态稳定性。结合自由能计算显示,MOL008550和MOL001870的结合自由能强于F4W501,且与exoS受体蛋白的作用方式和F4W501类似,主要为静电、疏水作用及范德华力促进两者间的结合,其可能对exoS表现出更高的抑制活性,为潜在的exoS靶向小分子抑制剂。虚拟筛选活性化合物并探究其与胞外酶S的互作模式及动力学稳定性,为开发新型的高效靶向exoS抑制剂提供了研究思路和物质参考。

关 键 词：铜绿假单胞菌 胞外酶 分子对接 虚拟筛选  分子动力学模拟

分 类 号：R284[中药学类]