文献类型：期刊文章

作　　者：徐明鑫[1,2] 陈双扣[1,2] 谭小庆[1,2] 任风鸣[3] 管天冰[1,2]

XU Ming-xin;CHEN Shuang-kou;TAN Xiao-qing;REN Feng-ming;GUAN Tian-bing(Chongqing Key Laboratory of Industrial Fermentation Microorganism(Chongqing University of Science and Technology),Chongqing 401331,China;Department of Chemistry and Chemical Engineering,Chongqing University of Science and Technology,Chongqing 401331,China;Institute of Medicinal Plant Cultivation,Chongqing 408435,China)

机构地区：[1]工业发酵微生物重庆市重点实验室(重庆科技学院),重庆401331 [2]重庆科技学院化学化工学院,重庆401331 [3]重庆市药物种植研究所,重庆408435

出　　处：《中国药学杂志》

基　　金：工业发酵微生物重庆市重点实验室开放基金项目资助(GYFJWSW-08)。

年　　份：2023

卷　　号：58

期　　号：10

起止页码：875-883

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2020、CAS、CSCD、CSCD2023_2024、EMBASE、IC、JST、PUBMED、RCCSE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：目的基于分子对接的虚拟筛选和体外抑菌实验快速筛选出DNA拓扑异构酶Ⅳ抑制剂。方法采用AutoDock Vina程序对DNA拓扑异构酶Ⅳ的3个靶点蛋白1S16、3FV5和4ZH0进行方法学研究,通过均方根偏差(RMSD)、曲线下面积(AUC)、富集因子(EF)等参数评估对活性分子富集能力较强的分子对接模型,并利用该模型对数据库进行大规模的虚拟筛选,保留结合能低于阈值的化合物开展体外抑菌实验。结果综合回溯性验证结果发现1S16靶点蛋白的分子对接模型具有较强的活性分子富集能力,基于该模型虚拟筛选出22个具有潜在抑菌活性的化合物,体外抑菌实验发现其中8个化合物具有明显的抗大肠杆菌活性。结论本研究发现8个化合物具有明确的抗大肠杆菌活性,有望成为新型DNA拓扑异构酶Ⅳ抑制剂。

关 键 词：DNA拓扑异构酶Ⅳ  分子对接 大肠杆菌 体外抑菌

分 类 号：R914.2]