文献类型：期刊文章

作　　者：陈瑞枫[1] 王瑄[2] 马枫茜[1] 李祥芳[1] 丁寿鹏[1] 吴利先[1]

CHEN Rui-feng;WANG Xuan;MA Feng-xi;LI Xiang-fang;DING Shou-peng;WU Li-xian(Department of Medical Microbiology and Immunology,School of Basic Medical Sciences,Dali University,Dali 671000,China;Nanchang University Queen Mary School,Nanchang 330031,China)

机构地区：[1]大理大学基础医学院医学微生物学与免疫学教研室,云南大理671000 [2]南昌大学玛丽女王学院,江西南昌330031

出　　处：《中国感染控制杂志》

基　　金：国家自然科学基金项目(81260456);云南省地方本科高校基础研究重点项目(202101BA07111-038)。

年　　份：2023

卷　　号：22

期　　号：6

起止页码：621-628

语　　种：中文

收录情况：AJ、BDHX、BDHX2020、CAS、CSCD、CSCD2023_2024、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：目的 通过生物信息学软件预测结核分枝杆菌Rv3529c基因编码蛋白的结构和功能,并对其进行原核表达。方法 利用UniproKB数据库、PredictProtein服务、AlphaFold系统、SWISS-MODEL服务、ProtParam蛋白分析工具、ProtScale、DeepTMHMM服务和SignalP-5.0服务、ProtCompB方法、IEDB数据库和STRING数据库等生物信息学预测软件对Rv3529c编码蛋白的二级和三级结构、理化性质、疏水性、信号肽、跨膜区、亚细胞定位及免疫表位进行分析预测。利用分子克隆技术构建表达质粒载体pET-32a-Rv3529c并进行原核表达,运用UniprotKB数据库的Blast工具对氨基酸序列进行比对,采用MEGA 11软件构建进化树,进行系统进化分析,运用STRING数据库分析蛋白间相互作用。结果 Rv3529c基因全长1 155 bp,共编码384个氨基酸。Rv3529c基因编码蛋白分子量为43.35 kDa,等电点为6.04,二级结构以α-螺旋为主,该蛋白为稳定的亲水性蛋白,无跨膜区、无信号肽,预测该蛋白亚细胞定位在细胞质中或细胞膜上,存在多个抗原抗体表位,与多个蛋白质有相互作用。经克隆、表达、鉴定、纯化后获得浓度和纯度较高的Rv3529c蛋白。结论 成功克隆、表达、纯化结核分枝杆菌Rv3529c蛋白,并初步预测其结构及功能。

关 键 词：结核分枝杆菌 Rv3529c蛋白  原核表达 生物信息学 表位

分 类 号：R521]