文献类型：期刊文章

作　　者：唐田书[1] 许德华[1] 刘金婵[1] 陈铭[1] 陈晓琳[1] 饶绍奇[1]

TANG Tianshu;XU Dehua;LIU Jinchan;CHEN Ming;CHEN Xiaolin;RAO Shaoqi(Institute for Medical Systems Biology,School of Public Health,Guangdong Medical University,Guangdong Province,Dongguan523000,China)

机构地区：[1]广东医科大学公共卫生学院医学系统生物学研究所,广东东莞523000

出　　处：《中国医药导报》

基　　金：国家自然科学基金资助项目(81373085)。

年　　份：2023

卷　　号：20

期　　号：15

起止页码：22-26

语　　种：中文

收录情况：CAS、JST、RCCSE、ZGKJHX、普通刊

摘　　要：目的利用公共转录组RNA测序数据系统性地探索与胰腺导管腺癌(PDAC)预后相关的自噬长链非编码RNA(lncRNA)及潜在的治疗药物。方法从TCGA数据库中获取PDAC患者转录组数据(RNA-seq)及临床数据。采用Pearson相关分析确定与自噬基因表达相关的lncRNAs(ARlncRNA)。利用单因素Kaplan-Meier法和多因素Cox回归分析筛选重要的与PDAC患者预后相关的ARlncRNA,构建受ARlncRNA调控的基因网络识别核心基因。最后,借助蛋白质互作网络和药物-基因相互作用数据库(DGIdbs)识别分子靶向药物。结果筛选出12个ARlncRNA与PDAC患者预后相关,10个共表达mRNA(核心基因)对患者总生存期有显著影响。富集分析主要为自噬通路。网络分析和数据库挖掘发现了3个PDAC潜在治疗药物(阿法替尼、达克替尼和奥希替尼)。结论建立ARlncRNA-mRNA网络以期揭示PDAC的发病机制和识别分子标记,经DGIdbs识别3个PDAC潜在治疗药物。

关 键 词：胰腺导管腺癌 自噬 长链非编码RNA 预后  靶向药物

分 类 号：R730.7]