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2017-2019年呼和浩特市甲型A(H1N1)pdm09流感病毒基因特征分析
Genetic characterization of the influenza A(H1N1)pdm09 virus in Hohhot,2017-2019
文献类型:期刊文章
LIU Dong-yang;YANG Yue-qing;FAN Hong-xia;LUO Yun;YANG Hai-rong;HAO Jian-feng;LI Hai-ling;LIU Yan-chao;GAO Yu-min(Department of Epidemiology,School of Public Health,Inner Mongolia Medical University,Hohhot 010110,China;Department of Laboratory,Hohhot Center for Disease Control and Prevention,Hohhot 010070,China;Key Laboratory of Molecular Epidemiology of Chronic Diseases,Inner Mongolia Medical University,Hohhot 010110,China)
机构地区:[1]内蒙古医科大学公共卫生学院流行病学教研室,呼和浩特010110 [2]呼和浩特市疾病预防控制中心检验科,呼和浩特010070 [3]内蒙古医科大学慢性病分子流行病学重点实验室,呼和浩特010110
基 金:内蒙古自治区自然科学基金项目(No.2019MS08029)。
年 份:2023
卷 号:39
期 号:4
起止页码:376-382
语 种:中文
收录情况:AJ、BDHX、BDHX2020、CAB、CAS、CSCD、CSCD2023_2024、IC、JST、RCCSE、WOS、ZGKJHX、核心刊
摘 要:目的了解呼和浩特市甲型A(H1N1)pdm09流感病毒遗传进化特征及抗原位点、糖基化位点和耐药位点的变异情况,为流感防控提供科学依据。方法采集2017-2019年呼和浩特市3家哨点医院的流感样病例(ILI)咽拭子标本进行核酸检测,阳性样本通过MDCK细胞和鸡胚进行病毒分离。随机抽取15株甲型A(H1N1)pdm09流感毒株进行基因测序分析。采用MEGA7.0.14软件、DNASTAR7.0.1软件和NetNGlyc1.0软件进行基因进化树分析、核苷酸同源性分析和糖基化位点分析。结果呼和浩特市2017-2019年15株甲型A(H1N1)pdm09分离株与疫苗株A/Brisbane/02/2018和A/Michigan/45/2015共同属于6B.1分支。各年度分离株与疫苗株A/Brisbane/02/2018的组间遗传距离分别为0.004、0.011和0.013。相较于疫苗株A/California/07/2009和A/Michigan/45/2015,2017年起甲型A(H1N1)pdm09病毒抗原位点变异较大,但与疫苗株A/Brisbane/02/2018相比并未发生抗原漂移现象,与疫苗株匹配效果较好。分离株与疫苗株A/California/07/2009相比多了糖基化位点162NQS/T。分离株与神经氨酸酶抑制剂耐药相关的9个关键氨基酸位点没有发生变异。结论随着时间推移,呼和浩特市甲型A(H1N1)pdm09流感病毒与疫苗株的基因相似性逐渐降低,提示呼和浩特市病毒在不断进化中,应持续监测。本次研究中的分离株与WHO推荐的2019-2020年北半球疫苗株A/Brisbane/02/2018相比未发生抗原漂移现象,WHO推荐的疫苗株对目前流行的甲型A(H1N1)pdm09流感仍有较好的保护效果。所有分离株NA基因均未发生H275Y耐药突变,提示呼和浩特市流行的甲型A(H1N1)pdm09流感仍然对奥司他韦等NA抑制剂药物敏感。
关 键 词:甲型A(H1N1)pdm09 流感病毒 血凝素 神经氨酸酶 基因特征
分 类 号:R373.1]
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