文献类型：期刊文章

作　　者：张心怡[1] 谢秀烨[1] 苏华清[1] 石贤爱[1,2] 王国增[1,2]

ZHANG Xinyi;XIE Xiuye;SU Huaqing;SHI Xian’ai;WANG Guozeng(Institute of Pharmaceutical Biotechnology and Engineering,College of Biological Science and Engineering,Fuzhou University,Fuzhou,Fujian 350108,China;Fujian Key Lab of Medical Instrument and Pharmaceutical Technology,Fuzhou,Fujian 350108,China)

机构地区：[1]福州大学生物科学与工程学院,药物生物技术与工程研究所,福建福州350108 [2]福建省医疗器械和医药技术重点实验室,福建福州350108

出　　处：《福州大学学报（自然科学版）》

基　　金：福建省自然科学基金资助项目(2019J01237);农业农村部饲料生物技术重点实验室开放课题资助项目。

年　　份：2023

卷　　号：51

期　　号：3

起止页码：431-438

语　　种：中文

收录情况：AJ、BDHX、BDHX2020、CAS、JST、MR、RCCSE、ZGKJHX、ZMATH、核心刊

摘　　要：采用高通量扩增子测序技术,对山羊瘤胃微生物宏基因组第10家族(GH10)和第11家族(GH11)木聚糖酶基因多样性进行分析.经序列拼接、过滤和可操作分类单元聚类(<95%),获得348个GH10木聚糖酶基因.GH10木聚糖酶基因片段与GenBank数据库中已知蛋白序列的一致性为46%~97%,其中一半以上的序列与已知木聚糖酶的一致性低于80%.序列注释结果表明,GH10木聚糖酶基因分布于5个门,其中拟杆菌门(Bacteroidetes)和厚壁菌门(Firmicutes)为优势门.经序列处理分析,获得143个GH11木聚糖酶基因,与GenBank中已知蛋白序列的一致性为51%~100%.GH11木聚糖酶基因分布于6个门,其中子囊菌门(Ascomycota)和放线菌门(Actinobacteria)为优势门.基于片段序列和染色体步移技术,获得两个新的全长木聚糖酶基因,由其编码的蛋白具有特殊的结构域组成.本研究表明,山羊瘤胃环境中GH10木聚糖酶基因的多样性远高于GH11,且两者的分布存在较大差异.此外,该环境中还存在大量的新木聚糖酶基因,可为后续木聚糖酶基因资源的发掘和应用奠定基础.

关 键 词：木聚糖酶  瘤胃 基因多样性 宏基因组学 扩增子测序  

分 类 号：Q939.9] Q812