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期刊文章详细信息

CVA6高通量测序方法的建立及应用    

Establishment and application of CVA6 high-throughput sequencing method

  

文献类型:期刊文章

作  者:裴书君[1] 李懿[2] 卢世栋[2] 索文帅[3] 王笑阳[3] 陈泽倩[3] 王若琳[3] 黄学勇[1,2]

PEI Shu-jun;LI Yi;LU Shi-dong;SUO Wen-shuai;WANG Xiao-yang;CHEN Ze-qian;WANG Ruo-lin;HUANG Xue-yong(Department of Epidemiology and Health Statistics,School of Public Health,Xinxiang Medical College,Xinxiang,Henan 453000,China)

机构地区:[1]新乡医学院公共卫生学院流行病与卫生统计学教研室,河南新乡453000 [2]河南省疾病预防控制中心传染病预防控制所 [3]郑州大学公共卫生学院流行病与卫生统计学教研室

出  处:《现代预防医学》

基  金:新发与重点传染病预防控制研究(YXKC2020006);EV-A71感染神经胶质瘤细胞的比较蛋白质组学的研究(LHGJ20190694)。

年  份:2023

卷  号:50

期  号:9

起止页码:1700-1705

语  种:中文

收录情况:BDHX、BDHX2020、CAB、CAS、IC、RCCSE、ZGKJHX、核心刊

摘  要:目的建立柯萨奇病毒A组6型(Coxsackievirus A6,CVA6)基于多重PCR扩增的高通量测序方法,并应用于CVA6的基因进化研究。方法利用PRIMER5.0设计7对CVA6型特异性引物,在同一体系构建并优化多重PCR高通量测序方法,并应用该方法对河南省39份CVA6标本开展基因测序,分析核苷酸氨基酸同源性和构建系统进化树。结果本研究成功建立基于多重PCR的CVA6高通量测序方法,基因特征分析表明此次河南省检出的CVA6流行亚型为D3a亚型,与山东、湖南、浙江、云南、辽宁、江西等地区的毒株亲缘关系较近。结论本研究建立CVA6的高通量测序方法特异性强,扩增效率高,为CVA6型基因型遗传特征和变异规律提供了技术支持,可应用于CVA6的同源性分析及基因进化研究分析。

关 键 词:CVA6  多重PCR引物  高通量测序 系统进化

分 类 号:Q811.4[生物工程类]

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同被引文献:

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