文献类型：期刊文章

作　　者：范文强[1] 刘雪霞[1] 马小兰[1] 杨花[1] 朱金忠[2] 唐建宁[3] 岳思君[1] 郑蕊[1]

FAN Wen-qiang;LIU Xue-xia;MA Xiao-lan;YANG Hua;ZHU Jin-zhong;TANG Jian-ning;YUE Si-jun;ZHENG Rui(Key Laboratory of Ministry of Education for Protection and Utilization of Special Biological Resources in Western China,Key Laboratory of Modern Molecular Breeding for Dominant and Special Crops in Ningxia,College of Life Science,Ningxia University,Yinchuan 750021,China;Qixin Wolfberry Seedling Professional Cooperatives of Zhongning County,Zhongning 755100,China;Wolfberry Industry Development Center,Yinchuan 750021,China)

机构地区：[1]宁夏大学生命科学学院,西部特色生物资源保护与利用教育部重点实验室,宁夏优势特色作物现代分子育种重实验室,宁夏银川750021 [2]中宁县杞鑫枸杞苗木专业合作社,宁夏中宁755100 [3]宁夏枸杞产业发展中心,宁夏银川750021

出　　处：《中草药》

基　　金：宁夏枸杞产业发展中心项目“宁夏枸杞核心种质资源差异性分析及功能基因挖掘”;宁夏回族自治区重点研发计划重点项目(2022BBF02010)。

年　　份：2023

卷　　号：54

期　　号：7

起止页码：2226-2234

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2020、CAB、CAS、CSCD、CSCD2023_2024、EMBASE、IC、JST、RCCSE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：目的探知宁夏枸杞Lyciumbarbarum雄性不育发生涉及的相关基因。方法以雄性不育品种“宁杞5号”和正常可育品种“宁杞1号”单双核花粉时期花药为材料,构建c DNA文库,Illumina HiSeq2500高通量平台进行转录组测序。结果组装得到14154条Unigenes序列,在错误发现率(false discovery rate,FDR)<0.05且差异倍数(fold change,FC)≥2的条件下,获得3012个差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),其中,有2327个DEGs在NCBI的非冗余蛋白质数据库(non-redundant protein databasse,NR)、基因本体数据库(gene ontology,GO)、直源同源群集数据库(clusters of orthologous groups,COG)、基因功能和代谢途径数据库(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)、真核同源群数据库(eu Karyotic orthologous Groups,KOG)、去冗余的蛋白序列数据库(swiss prot protein database,Swiss-Prot)等数据库中有注释信息。相对于“宁杞1号”,在“宁杞5号”中有1019个DEGs上调,1993个DEGs下调。GO分析表明,1116个DEGs被注释到生物学过程、细胞组分和分子功能中;此外,693个DEGs富集到KEGG数据库的50条代谢通路。结合PubMed文献库检索,筛选到细胞色素P450类蛋白(cytochrome P45098A3-like,CYP450)、受体蛋白激酶(receptor-like protein kinase,RPK)、果胶裂解酶(pectate lyase-like,PLL)、查耳酮合酶(chalcone synthase,CHS)、花药特异蛋白(anther-specific protein,ASP)等23个参与雄性不育相关基因,选取其中9个基因进行qRT-PCR分析,结果与转录组测序基因表达趋势一致。结论为进一步通过转基因技术验证基因功能提供了候选基因,为解析宁夏枸杞雄性不育发生的分子机制提供了研究基础。

关 键 词：宁夏枸杞 雄性不育 转录组 差异表达基因 单双核花粉时期  

分 类 号：R286.12[中药学类]