文献类型：期刊文章

作　　者：喻莹[1] 刘玉婷[1] 黎桂珍[2] 梁景皓[2] 李彬彬[1]

YU Ying;LIU Yuting;LI Guizhen;LIANG Jinghao;LI Binbin(Department of Pathophysiology,Basic Medicine College,Guangdong Medical University,Dongguan 523808,China;Department of Biotechnology,Basic Medicine College,Guangdong Medical University,Dongguan 523808,China)

机构地区：[1]广东医科大学基础医学院病理生理学教研室,广东东莞523808 [2]广东医科大学基础医学院生物技术系,广东东莞523808

出　　处：《中国医科大学学报》

基　　金：国家自然科学基金(81502411);广东省自然科学基金(2023A1515010448);广东省大学生创新创业训练计划项目(S202110571091,S202210571047)。

年　　份：2023

卷　　号：52

期　　号：4

起止页码：294-300

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2020、CAB、CAS、IC、JST、RCCSE、WOS、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：目的基于数据库分析剪接因子SRSF11在胃癌中的表达及其与临床病理特征、预后的关系,并探讨相关机制。方法基于癌症基因组图谱(TCGA)、基因表达综合(GEO)数据库分析SRSF11在胃癌中的表达情况;利用UALCAN、KM Plotter评估SRSF11表达与临床病理特征、预后的关系;利用TIMER工具分析SRSF11表达对肿瘤微环境免疫细胞浸润的影响;结合TCGA spliceSeq中可变剪接数据和RNA-seq数据分析SRSF11调控的可变剪接事件和基因,并对靶基因进行基因本体论(GO)和京都基因和基因组百科全书(KEGG)富集分析。结果胃癌组织中SRSF11表达明显上调(P<0.05),且与患者淋巴结转移和TP53基因突变有关(P<0.05);SRSF11高表达与胃癌患者预后不良相关(P<0.001);SRSF11表达可影响胃癌中多种免疫细胞的浸润水平,巨噬细胞高浸润量与患者预后不良相关(P<0.05);靶基因KEGG富集分析显示主要参与病毒感染、溶酶体、三磷酸腺苷结合盒转运体和肿瘤相关信号通路等。结论SRSF11在胃癌组织中呈现高表达,且与不良预后和免疫浸润相关。SRSF11有望成为胃癌诊断、预后评估和治疗的新靶点。

关 键 词：胃癌 SRSF11  可变剪接 生物信息学

分 类 号：R735.2]