文献类型：期刊文章

作　　者：肖志远[1] 宋冰[2] 马鑫雨[3] 金连辉[1] 郑通[1] 柴芳[1]

XIAO Zhiyuan;SONG Bing;MA Xinyu;JIN Lianhui;ZHENG Tong;CHAI Fang(Department of Thyroid Surgery,First Affiliated Hospital,Jinzhou Medical University,Jinzhou 121001,China;Department of Endocrinology and Metabolic Diseases,First Affiliated Hospital,Jinzhou Medical University,Jinzhou 121001,China;Department of Vocational Health and Environmental Health,School of Public Health,Jinzhou Medical University,Jinzhou 121001,China)

机构地区：[1]锦州医科大学附属第一医院甲状腺外科,辽宁锦州121001 [2]锦州医科大学附属第一医院内分泌与代谢性疾病科,辽宁锦州121001 [3]锦州医科大学公共卫生学院职业卫生与环境卫生学教研室,辽宁锦州121001

出　　处：《吉林大学学报（医学版）》

基　　金：辽宁省科技厅自然科学基金项目(2021-MS-333)。

年　　份：2023

卷　　号：49

期　　号：2

起止页码：473-481

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2020、CAS、CSCD、CSCD_E2023_2024、EMBASE、IC、JST、RCCSE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：目的:通过生物信息学方法探讨细胞凋亡相关基因(ARGs)透明质酸受体蛋白CD44在甲状腺癌(THCA)组织中表达及其与患者临床病理特征和肿瘤浸润淋巴细胞(TILs)的关系,为THCA的诊断和治疗提供新的研究方向。方法:从癌症基因组图谱(TCGA)数据库获得THCA凋亡相关的差异表达基因(DEGs)表达谱,选取表达上调的CD44基因,分析THCA组织和癌旁组织中CD44 mRNA表达水平;采用受试者工作特征(ROC)曲线对THCA组织与癌旁组织进行鉴别;采用基因本体功能注释(GO)、京都基因与基因组百科全书(KEGG)和基因集富集分析(GSEA)对DEGs进行功能及通路富集分析;采用STRING数据库建立蛋白-蛋白互作(PPI)网络,通过Cytoscape软件进行可视化;采用TIMER数据库分析THCA组织中CD44 mRNA表达和TILs浸润丰度之间的相关性;使用R语言分析CD44蛋白表达与免疫检查点的关系。选取110例THCA患者标本,采用免疫组织化学SABC法检测THCA组织及相对应的癌旁组织中CD44蛋白表达情况。结果:TCGA数据库分析,与癌旁组织比较,THCA组织中CD44 mRNA表达水平明显升高(P<0.05);ROC曲线分析,在临界值为6.855时,CD44的灵敏度、特异度和准确性分别为89.71%、75.13%和72.91%;GO和KEGG分析,DEGs主要富集在凋亡相关通路;GSEA分析,DEGs与中性粒细胞脱颗粒反应有关;TIMER数据库分析,THCA组织中CD44 mRNA表达水平与B细胞、巨噬细胞、CD4+T淋巴细胞、树突状细胞和中性粒细胞浸润丰度呈正相关关系(partial. cor>0,P<0.01),与肿瘤纯度和CD8+T淋巴细胞浸润丰度无关(partial. cor≤0,P<0.01);在THCA组织中CD44蛋白表达水平与9个免疫检查点基因呈正相关关系(P<0.01),与1个免疫检查点基因呈负相关关系(P<0.01);免疫组织化学SABC法检测,THCA组织中CD44蛋白阳性表达率高于癌旁组织(P<0.01);THCA组织中CD44蛋白表达与肿瘤直径和淋巴结转移有关(P<0.05),与患者性别、年龄和腺外侵犯无关(P>0.05)。结论:

关 键 词：甲状腺肿瘤  生物信息学  透明质酸受体蛋白  肿瘤免疫浸润  免疫检查点  

分 类 号：R736.1]