文献类型：期刊文章

作　　者：侯志娟[1] 文普帅[1,2]

HOU Zhijuan;WEN Pushuai(Department of Pathophysiology,College of Basic Medical Science,Jinzhou Medical University,Jinzhou 121001,China;Biological Anthropology Institute,Jinzhou Medical University,Jinzhou 121001,China)

机构地区：[1]锦州医科大学基础医学院病理生理学教研室,辽宁锦州121001 [2]锦州医科大学生物人类学研究所,辽宁锦州121001

出　　处：《中国医科大学学报》

基　　金：辽宁省教育厅青年科技人才“育苗”项目(JYTQN201921)。

年　　份：2023

卷　　号：52

期　　号：2

起止页码：126-131

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2020、CAB、CAS、IC、JST、RCCSE、WOS、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：目的 通过生物信息学方法探讨结直肠癌转移的分子机制,为结直肠癌转移提供潜在的治疗靶点。方法 从高通量基因表达数据库(GEO)下载GSE41568数据集,用Limma软件包筛选转移性和原发性结直肠癌的差异表达基因;通过加权基因共表达网络分析(WGCNA)筛选与结直肠癌不同转移部位相关的核心模块和核心基因;使用STRING和Cytoscape构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络;利用PROGgenesV2数据库进行预后分析。通过基因集富集分析(GSEA)预测基因参与结直肠癌的潜在分子机制。结果 共获得1 159个差异表达基因,由703个上调基因和456个下调基因组成。共表达模块中,前50个核心基因的基因本体(GO)功能富集分析表明,基因主要与创伤反应和急性炎症反应相关。通过PPI网络筛选的3个核心基因APOH、KNG1和FGG对结直肠癌患者的预后有显著影响。结论 APOH、KNG1和FGG与结直肠癌患者的预后呈负相关,这些基因有望成为结直肠癌的诊断生物标志物或治疗靶点。

关 键 词：结直肠癌 转移  差异表达基因 加权基因共表达网络分析  

分 类 号：R735.3]