期刊文章详细信息
基于SSR-seq技术评估中间球海胆多代选育群体和普通养殖群体的遗传多样性
Evaluation of the genetic diversity and genetic structure of multiple generation selection populations and unselected common population of sea urchin(Strongylocentrotus intermedius)using SSR-seq
文献类型:期刊文章
LIU Lei;ZHANG Weijie;LIU Yansong;LENG Xiaofei;OU Fanjiang;ZANG Xiaoning;LI Xuguang;DING Jun;CHANG Yaqing(Key Laboratory of Mariculture&Stock Enhancement in North China’s Sea,Ministry of Agriculture and Rural Affairs,Dalian Ocean University,Dalian 116023,China;Dalian Haibao Fisheries Co.,Ltd.,Dalian 116041,China)
机构地区:[1]大连海洋大学,农业农村部北方海水增养殖重点实验室,辽宁大连116023 [2]大连海宝渔业有限公司,辽宁大连116045
基 金:国家重点研发计划(2018YFD0901601);农业农村部农业科研杰出人才及创新团队项目;大连市高层次人才创新支持计划(2019RQ122);辽宁省教育厅面上项目(LJKZ0702)。
年 份:2023
卷 号:47
期 号:3
起止页码:143-153
语 种:中文
收录情况:AJ、BDHX、BDHX2020、CAB、CAS、CSCD、CSCD2023_2024、IC、JST、RCCSE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、核心刊
摘 要:为明确不同选育群体中间球海胆的遗传多样性和遗传结构,利用SSR-seq技术和15个微卫星位点,对1个家系选育群体(FP)、1个群体选育群体(IP)和1个未经选育的普通养殖群体(CP)的遗传多样性及遗传结构进行了分析。结果显示,15个微卫星位点共检测出112个等位基因,FP、IP、CP 3个群体的平均观测等位基因数(N_(a))分别为5.077、5.133和6.133个,平均有效等位基因(N_(e))分别为2.816、2.873和3.638个,平均观测杂合度(H_(o))分别为0.522、0.441和0.501,平均期望杂合度(H_(e))分别为0.595、0.599和0.667,平均多态性信息含量(PIC)分别为0.546、0.543和0.623。家系选育群体(FP)H_(e)与H_(o)的差值(0.073)低于IP(0.158)和CP(0.166),平均固定指数(F)(0.115)低于IP(0.248)和CP(0.246)。3个群体间遗传分化系数(F_(st))介于0.018~0.176,为中低等程度的遗传分化。分子方差分析(AMOVA)结果显示,3个群体的遗传变异主要源于个体间。主成分分析(PCoA)和聚类进化树结果均显示,3个群体之间的亲缘关系较近,其中IP群体遗传分化程度最高。研究表明,3个中间球海胆群体均具有较高的遗传多样性,多代家系选育和群体选育均未明显降低群体的遗传多样性,家系选育更有利于保持群体的杂合度和控制群体的近交水平,群体选育则会提升群体的遗传分化程度。
关 键 词:中间球海胆 选育群体 遗传多样性 遗传结构 微卫星
分 类 号:Q347] S968.9]
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