文献类型：期刊文章

作　　者：翟新国[1] 李朋辉[1] 苏金辉[2] 李庆阳[2] 张若冰[2] 郑培培[1]

ZHAI Xinguo;LI Penghui;SU Jinhui;LI Qingyang;ZHANG Ruobing;ZHENG Peipei(Department of Veterinary Medicine,School of Life Sciences and Food Engineering,Hebei University of Engineering,Handan 056038,China;Hebei Dabeinong Farming and Animal Husbandry Food Co.,Ltd.,Hengshui 053900,China)

机构地区：[1]河北工程大学生命科学与食品工程学院动物医学系,河北邯郸056038 [2]河北大北农农牧食品有限公司,河北衡水053900

出　　处：《黑龙江畜牧兽医》

基　　金：河北工程大学创新基金项目“河北省猪场主要病毒性传染病的流行病学调查”;畜禽病原微生物学湖北省重点实验室开放课题项目(KLPCAAB-2020-05)。

年　　份：2023

期　　号：5

起止页码：80-86

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2020、CAS、RCCSE、核心刊

摘　　要：为了监测河北省及周边地区猪圆环病毒2型(Porcine circovirus 2,PCV-2)的流行性和遗传变异性,试验采集河北省及周边地区猪场疑似患断奶仔猪多系统衰竭综合征(PCVAD)仔猪的组织病料,提取DNA,采用PCR方法进行PCV-2全基因组扩增、克隆和测序,采用DNAStar软件对PCV-2测序结果进行剪辑、拼接和同源性分析,利用MEGA X 10.0.5软件对PCV-2基因组进行遗传进化分析,利用RDP4软件对PCV-2基因组进行重组分析。结果表明:成功扩增并克隆出6株PCV-2毒株的基因组序列,6株分离株分别为河北沧州株HB/NG/2020(OM524507)、HB/WT/2020(OM524511)和HB/CZ/2020(OM524512),河北邯郸株HB/WA/2020(OM524508),河北邢台株HB/ZZ/2020(OM524509)及内蒙古乌兰察布株NMG/QQ/2020(OM524510);经测序和全长拼接,PCV-2基因组长度均为1768 bp。经同源性分析,6株PCV-2毒株基因组核苷酸序列的同源性为97.8%~100%,与4株国产疫苗参考株LG、ZJ、SH和DBN-SX07-2同源性较低,为95.2%~96.8%;6株PCV-2 Cap基因长度均为705 bp,编码234个氨基酸;Cap蛋白氨基酸序列在6个位点存在相同氨基酸突变,其中68(A→N)、134(T→N)和169(S→G)存在于主要抗原表位区上;6株PCV-2分离株均归属于PCV-2d基因型,与国产疫苗参考株LG、ZJ、SH和DBN-SX07-2亲缘关系较远,其中HB/NG/2020、HB/CZ/2020、HB/WA/2020、HB/ZZ/2020和NMG/QQ/2020与我国参考株HN-MZ-2016亲缘关系最近,而HB/WT/2020与我国参考株201207JS亲缘关系最近;分离株HB/WT/2020基因组中存在1个重组事件,重组发生在PCV-2a基因型国产疫苗LG参考株和PCV-2d基因型流行毒株之间,重组区域为890~1628 nt,属于跨基因型重组。说明河北省及周边地区主要流行PCV-2d基因型毒株,HB/WT/2020株为跨基因型重组毒株,并且主要亲本为国产疫苗LG基因型。

关 键 词：河北及周边地区  猪圆环病毒2型 基因组 遗传变异  重组分析  

分 类 号：S855.3]