文献类型：期刊文章

作　　者：范苗苗[1] 赵奇[1] 毕佳欣[1] 刘馨璥[1] 宋洁[1]

Fan Miaomiao;Zhao Qi;Bi Jiaxin;Liu Xinjing;Song Jie(Department of Biology,School of Basic Medicine of Mudanjiang Medical University,Mudanjiang 157011,China)

机构地区：[1]牡丹江医学院基础医学院生物学教研室,牡丹江157011

出　　处：《肿瘤研究与临床》

年　　份：2023

卷　　号：35

期　　号：1

起止页码：29-34

语　　种：中文

收录情况：CAB、CAS、EMBASE、IC、JST、SCOPUS、ZGKJHX、普通刊

摘　　要：目的探究长链非编码RNA(lncRNA)HAGLR在乳腺癌中的表达情况及其对乳腺癌预后的影响,并构建竞争性内源RNA(ceRNA)网络。方法采用Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology网站检索HAGLR基因染色体定位及转录本表达情况。采用lnclocater网站预测HAGLR亚细胞定位。通过lnCAR数据库分析HAGLR在乳腺癌组织和癌旁组织的差异表达情况,按HAGLR表达水平,将lnCAR数据库患者分为HAGLR高表达组和HAGLR低表达组,采用Kaplan-Meier法分析两组间总生存(OS)及无转移生存情况,并通过UCSC Xena数据库进行验证。通过lnCAR数据库检索HAGLR共表达基因,将排位前200个共表达基因提交至Metascape网站,进行基因本体(GO)、京都基因和基因组百科全书(KEGG)功能富集分析,构建蛋白互作网络(PPI)。采用生物信息学在线分析网站starbase预测HAGLR靶向的微RNA(miRNA)和可直接编码蛋白的mRNA,通过Cytoscape3.8软件构建HAGLR的ceRNA网络。结果HAGLR基因定位于2q31.1,主要分布于细胞质;HAGLR在乳腺癌组织中的表达水平高于癌旁组织,差异有统计学意义(P<0.001)。对lnCAR数据库和UCSC Xena数据库分析均显示,HAGLR高表达组OS较低表达组均差(均P<0.01);lnCAR数据库中HAGLR高表达组无转移生存较低表达组差(P=0.030)。前200个HAGLR共表达基因中与HAGLR负相关基因129个,与HAGLR正相关基因71个。KEGG通路分析显示,HAGLR与代谢通路、MAPK信号通路、JAK-STAT信号通路及癌症通路有关;GO注释分析显示,HAGLR主要富集在细胞周期、着丝粒复合体组装、有丝分裂进程、蛋白激酶结合、激酶活性的调节、细胞对DNA损伤刺激的反应等多种功能中。hsa-miR-130b-3p、hsa-miR-1245b-5p、hsa-miR-182b-5p、hsa-miR-512-3p、hsa-miR-302b-3p、hsa-miR-185b-5p、hsa-miR-106b-5p为HAGLR靶向miRNA。结论HAGLR在乳腺癌组织中高表达,其可能是乳腺癌预后预测的生物标志物。

关 键 词：乳腺肿瘤  医学信息学 RNA,长链非编码  HAGLR  竞争性内源RNA  预后

分 类 号：R737.9]