期刊文章详细信息
猪产业链中鼠伤寒沙门菌及沙门菌血清型4,[5],12:i:-基因组学分析
Genomic Analysis of Salmonella Typhimurium Isolates and Salmonella Serotype 4,[5],12:i:-Isolates from Pig-borne Food Chain
文献类型:期刊文章
JIANG Zenghai;TENG Lin;HE Anwen;LIU Yanyan;YUE Min;HE Qigai(College of Veterinary Medicine,Henan University of Animal Husbandry and Economy,Zhengzhou 450046,China;Institute of Preventive Veterinary Medicine&Department of Veterinary Medicine,College of Animal Sciences,Zhejiang University,Hangzhou 310058,China;College of Veterinary Medicine,Huazhong Agricultural University,Wuhan 430070,China)
机构地区:[1]河南牧业经济学院动物医药学院,郑州450046 [2]浙江大学动物科学学院动物医学系&动物预防医学研究所,杭州310058 [3]华中农业大学动物医学院,武汉430070
基 金:河南省科技攻关(212102110096);浙江省重点研发计划(2020C02032;2021C02008);财政部和农业农村部:国家现代农业产业技术体系资助项目(CARS-35);河南牧业经济学院博士启动基金(2022HNUAHEDF027)。
年 份:2023
卷 号:54
期 号:3
起止页码:1199-1209
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2020、CAB、CAS、CSCD、CSCD2023_2024、EMBASE、IC、JST、RCCSE、WOS、ZGKJHX、核心刊
摘 要:旨在探究鼠伤寒沙门菌及沙门菌血清型4,[5],12:i:-基因组学特征。采用Illumina NovaSeq 6000平台对91株河南省猪产业链中鼠伤寒沙门菌及沙门菌血清型4,[5],12:i:-分离菌进行全基因组测序,通过生物信息学分析,进行其血清型的预测、多位点序列的分型以及质粒类型、耐药基因和毒力基因分析。结果表明,在河南省猪产业链中沙门菌4,[5],12:i:-的流行率(1.58%,50/3173)已经超过鼠伤寒沙门菌的流行率(1.29%,41/3173);91株沙门菌的序列型分为ST34(71.42%,65/91)和ST19(28.57%,26/91);鼠伤寒沙门菌/ST34菌株和4,[5],12:i:-/ST34菌株都是IncHI2A_1、IncHI2_1和Col440I_1质粒的偏好宿主;沙门菌血清型4,[5],12:i:-携带率较高的耐药基因是blaTEM-1B_1(72%)、tet(B)_2(90%)、sul2_3(66%)、blaOXA-1_1(34%)等;相比鼠伤寒沙门菌菌株,沙门菌血清型4,[5],12:i:-菌株中质粒的携带率更高,且携带更多种类的耐药基因和毒力基因。本研究首次证实,河南省猪产业链中沙门菌血清型4,[5],12:i:-的流行已经超过鼠伤寒沙门菌,在一定程度上解释了该血清型在河南省病人中主要流行的原因。
关 键 词:沙门菌血清型4 [5] 12:i:- 鼠伤寒沙门菌单相变种 猪产业链 基因组学 耐药基因 毒力基因
分 类 号:S852.61]
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