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期刊文章详细信息

大豆NIN和NLP基因生物信息学分析及敲除载体构建    

Bioinformatics Analysis of Soybean NIN and NLP Genes and Knockout Vector Construction

  

文献类型:期刊文章

作  者:廖春梅[1] 陈丽玉[1] 杨涔[1] 刘宝辉[1] 孔凡江[1]

LIAO Chun-mei;CHEN Li-yu;YANG Cen;LIU Bao-hui;KONG Fan-jiang(School of Life Sciences/Innovative Center of Molecular Genetics and Evolution,Guangzhou University,Guangzhou 510030,China)

机构地区:[1]广州大学生命科学学院/分子遗传与进化创新研究中心,广东广州510030

出  处:《大豆科学》

基  金:广东省基础与应用基础研究重大项目(2019B030302006)。

年  份:2023

卷  号:42

期  号:1

起止页码:1-11

语  种:中文

收录情况:BDHX、BDHX2020、CAB、CAS、CSCD、CSCD_E2023_2024、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊

摘  要:为促进大豆NLP家族基因突变大豆材料的获得及大豆NIN和NLP基因功能的研究,本研究对大豆NIN和NLP基因进行生物信息学分析,通过CRISPR/Cas 9基因编辑技术构建基因敲除载体,并且通过大豆毛根转化实验验证靶点的有效性。结果表明:大豆基因组中一共存在4个NIN基因和10个NLP基因家族成员,这些基因都具有RWP-RK和PB1两个保守结构域。亚细胞定位预测表明所有成员都定位在细胞核中,此外GmNIN1b和GmNIN2a还定位于叶绿体。GmNIN1a/b、GmNIN2a/b、GmNLP2a/b及GmNLP3b在根瘤中的表达量相对较高,推测这些基因可能对结瘤过程具有重要的调控功能。成功构建了NLP4和NLP5两个敲除载体,得到可敲除GmNLP4a/b的3个有效靶点和敲除GmNLP5a/b的2个有效靶点。本研究获得了大豆NIN和NLP基因家族的生物信息学依据和创制GmNLP4a/b和GmNLP5a/b基因突变体的技术依据。

关 键 词:大豆 根瘤 NLP基因  生物信息学分析 CRISPR/Cas 9基因编辑技术  基因敲除载体 GmNLP4a/b  GmNLP5a/b  

分 类 号:S565.1]

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