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粳稻糖基转移酶Ⅰ基因家族全基因组鉴定及功能分析
Genome-wide Identification and Functional Analysis of GlycoltransferaseⅠGene Family in Japonica Rice
文献类型:期刊文章
ZHOU Zhenzhong;LUO Biao;LUO Ying;XIA Min;WANG Qiming;RAO Liqun(Hunan Engineering Laboratory for Good Agricultural Practice and Comprehensive Utilization of Famous-Region Medicinal Plants,College of Bioscience and Biotechnology,Hunan Agricultural University,Changsha 410128,China)
机构地区:[1]湖南农业大学生物科学技术学院,道地药用植物规范化栽培与综合利用湖南省工程实验室,湖南长沙410128
基 金:湖南省高校创新平台开放基金项目(13K063);科技部国家科技支撑计划项目(2014BAD01B04)。
年 份:2022
卷 号:37
期 号:6
起止页码:50-62
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2020、CAB、CSCD、CSCD2021_2022、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊
摘 要:糖基转移酶Ⅰ(GTⅠ)家族是糖基转移酶中的一类,其主要功能涉及黄酮类化合物糖基的转移、淀粉和蔗糖的合成等。为揭示GTⅠ基因家族在粳稻生长发育以及抗逆中的作用,为粳稻GTⅠ基因家族成员的功能研究提供基础,为水稻的品种改良和提高水稻耐高温提供思路,采用生物信息学方法鉴定出30个GTⅠ基因家族成员,并分析了粳稻GTⅠ基因家族成员的基因结构、蛋白质理化性质、染色体定位及基因进化、系统发育关系、保守结构域和蛋白质三维结构建模等。结果显示,粳稻的30个GTⅠ基因家族成员在水稻12条染色体上均有分布,其基因结构、保守基序和遗传进化相对保守,家族成员启动子均预测到脱落酸响应元件,家族蛋白质的三维结构保守含有6个β-折叠和7个α-螺旋。通过转录组数据与实时荧光定量分析,GTⅠ基因家族大部分成员对高温胁迫的响应出现在高温处理后第6小时,其中OS-GT29表达量呈持续高表达。GTⅠ基因家族在拟南芥和粳稻功能存在相似。
关 键 词:粳稻 糖基转移酶Ⅰ 基因家族 生物信息学 高温胁迫响应
分 类 号:S511.03] Q78]
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