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期刊文章详细信息

玉米株高和穗位高性状全基因组关联分析    

Genome-wide association analysis of plant height and ear height related traits in maize

  

文献类型:期刊文章

作  者:马雅杰[1] 鲍建喜[1] 高悦欣[1] 李雅楠[1] 秦文萱[1] 王彦博[1] 龙艳[1] 李金萍[2] 董振营[1,2] 万向元[1,2]

MA Ya-Jie;BAO Jian-Xi;GAO Yue-Xin;LI Ya-Nan;QIN Wen-Xuan;WANG Yan-Bo;LONG Yan;LI Jin-Ping;DONG Zhen-Ying;WAN Xiang-Yuan(Zhongzhi International Institute of Agricultural Biosciences,Shunde Graduate School,School of Chemistry and Biological Engineering,Research Center of Biology and Agriculture,University of Science and Technology Beijing(USTB),Beijing 100083,China;Beijing Engineering Laboratory of Main Crop Bio-Tech Breeding,Beijing International Science and Technology Cooperation Base of Bio-Tech Breeding,Beijing Solidwill Sci-Tech Co.Ltd.,Beijing 100192,China)

机构地区:[1]北京科技大学生物与农业研究中心/化学与生物工程学院/顺德研究生院/北京中智生物农业国际研究院,北京100083 [2]北京首佳利华科技有限公司/主要作物生物育种北京市工程实验室/生物育种北京市国际科技合作基地,北京100192

出  处:《作物学报》

基  金:国家重点研发计划项目“农业生物种质资源挖掘与创新利用”重点专项(2021YFD1200700)资助。

年  份:2023

卷  号:49

期  号:3

起止页码:647-661

语  种:中文

收录情况:AJ、BDHX、BDHX2020、CAB、CAS、CSCD、CSCD2023_2024、DOAJ、EAPJ、EBSCO、IC、JST、RCCSE、SCOPUS、ZGKJHX、核心刊

摘  要:适宜的株高和穗位高可提高植株的养分利用效率及抗倒伏性,对玉米增产和稳产具有重要意义。为揭示玉米株高和穗位高遗传机制,本研究以854份玉米自交系为关联群体,利用均匀分布于玉米10条染色体的2795个SNP标记对4个环境下玉米株高、穗位高以及穗位系数进行全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS)。共定位到81个显著关联SNP位点(P<0.0001),其中与株高显著关联的SNP为35个,单个位点表型解释率为0.02%~6.23%;与穗位高显著关联SNP为31个,单个位点表型变异解释率为0.03%~3.06%;与穗位系数显著关联的SNP位点为24个,单个位点表型变异解释率为0.03%~6.64%。进一步鉴定出15个可在2个及以上环境共定位的稳定SNP,其中6个为本研究首次发现,9个位于前人定位QTL区间或/和关联SNP位点2 Mb范围内。在15个稳定SNP位点上下游各200kb的置信区间共发现83个功能注释基因,结合文献分析筛选出了每个位点最有可能的候选基因,这些候选基因主要参与激素合成与信号转导、糖类代谢、细胞分裂调控等途径。鉴定出6个主效SNP位点,并发现1个可同时调控株高、穗位高和穗位系数的一因多效位点。本研究可为分子标记辅助选择育种提供有效遗传位点,为精细定位和克隆株高与穗位高相关性状基因提供参考。

关 键 词:玉米 株高 穗位高 全基因组关联分析 候选基因

分 类 号:S513]

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