文献类型：期刊文章

作　　者：黄青青[1] 李书珍[2] 杜晶晶[1] 石笑娜[1] 李克研[1]

Huang Qingqing;Li Shuzhen;Du Jingjing;Shi Xiaona;Li Keyan(Department of Cardiology,The First Affiliated Hospital of Jinzhou Medical University,Jinzhou 121000,China;Department of Biochemistry and Molecular Biology,College of Basic Medicine,Jinzhou Medical University,Jinzhou 121000,China)

机构地区：[1]锦州医科大学附属第一医院心血管内科,锦州121000 [2]锦州医科大学基础医学院生物化学与分子生物学教研室,锦州121000

出　　处：《解剖学杂志》

基　　金：辽宁省高校创新人才(LR2019028);辽宁省教育厅基金(jytqn201727,LJKZ0811);锦州医科大学大学生创新创业训练计划项目(201806);锦州医科大学生物人类学创新团队开放课题(JYLJ201702)。

年　　份：2022

卷　　号：45

期　　号：5

起止页码：439-444

语　　种：中文

收录情况：CAS、JST、ZGKJHX、普通刊

摘　　要：目的:通过生物信息学的方法预测扩张型心肌病(DCM)与慢性心力衰竭(CHF)发病的共同生物标志物,为临床上2种疾病的发病及相关性奠定理论基础。方法:从Gene Expression Omnibus(GEO)数据库下载芯片数据GSE3585,此为DCM和正常对照组原始数据,同时下载芯片数据GSE76701,此为CHF和对照组原始数据。通过R软件分析获得DCM和CHF发病的差异表达基因,并获得2种疾病发病的共同差异表达基因,进一步对共同差异表达基因进行GO和KEGG富集分析,构建差异表达基因的PPI相互作用网络图,获得扩张型心肌病和心衰发病的共同关键基因。结果:DCM的差异表达基因有240个,其中141个上调基因,99个下调基因,CHF的差异表达基因有654个,其中355个上调基因,299个下调基因。DCM和CHF共同的差异表达基因有36个,其中19个上调基因,17个下调基因。GO分析显示,差异表达基因主要集中在12种不同的生理、病理过程中,KEGG分析获得差异表达基因参与的主要信号通路为5条,预测7个关键差异表达基因,分别为:CD163、KYVE1、MRC1、VSIG4、FCER1G、S100A9、F13A1。结论:该研究初步探讨了DCM与CHF两种疾病发病分子机制,获得了两种疾病发病的共同差异表达基因,仍需进一步的实验研究对基因的表达和临床病理特征的相关性进行验证。

关 键 词：扩张型心肌病 慢性心力衰竭 生物信息学 差异表达基因

分 类 号：Q811.4[生物工程类] R542.2] R541.6]