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转录组分析揭示溶藻弧菌感染早期大黄鱼的免疫应答特征
TRANSCRIPTOME ANALYSIS REVEALED THE IMMUNE RESPONSE OF LARGE YELLOW CROAKER(LARIMICHTHYS CROCEA)IN EARLY STAGE OF VIBRIO ALGINOLYTICUS INFECTION
文献类型:期刊文章
CHENG An-Yi;WANG Yong-Yang;WENG Hua-Song;CHEN Xin-Hua;ZHANG Wei-Ni(Key Laboratory of Marine Biotechnology of Fujian Province,Institute of Oceanology,Fujian Agriculture and Forestry University,Fuzhou 350002,China;University Key Laboratory for Integrated Chinese Traditional and Western Veterinary Medicine and Animal Healthcare in Fujian Province,Fujian Agriculture and Forestry University,Fuzhou 350002,China;Ningde Fufa Fisheries Co.Ltd,Ningde 352100,China)
机构地区:[1]福建农林大学海洋研究院,福建省海洋生物技术重点实验室,福州350002 [2]福建农林大学,中西兽医结合与动物保健福建省高校重点实验室,福州350002 [3]宁德富发水产有限公司,宁德352100
基 金:国家自然科学基金(31802333)资助。
年 份:2022
卷 号:46
期 号:12
起止页码:1845-1854
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2020、CAB、CAS、CSCD、CSCD2021_2022、JST、RCCSE、WOS、ZGKJHX、核心刊
摘 要:为探究大黄鱼(Larimichthys crocea)抗溶藻弧菌(Vibrio alginolyticus)感染的免疫应答机制,研究通过转录组测序及生物信息学分析的手段,在转录组水平分析了溶藻弧菌感染24h后大黄鱼头肾中基因表达水平的变化,共获得1903个差异表达基因(Differentially expressed genes,DEGs),其中641个上调表达基因,1262个下调表达基因。通过Gene Ontology(GO)和Kyoto encyclopedia of genes and genomes(KEGG)富集分析发现,一些先天性免疫相关基因,包括补体(C1qbp、C1QL2和C7)、热休克蛋白(hspd1、hspa4、hspa5和hspa9)、抗菌肽(Hepcidin-1)、C型凝集素受体(Clec4e和MR1)、己糖激酶(hex1)、精氨酸酶(Arg-II)和线粒体翻译延伸因子(TUFM)等基因表达水平均显著上调;而许多与获得性免疫相关基因,包括T、B淋巴细胞增殖分化(FcR5和CCL17)、T细胞调控(TCRα、TCRβ、CD3ε、CD3γδ、CD3ζ、ZAP-70和ITK)及免疫球蛋白参与抗原识别(Ighv 5A、Ighv 914和Ighv XIG14)等基因表达水平均显著下调。结果表明,在感染早期,大黄鱼先天性免疫在抵御溶藻弧菌感染中发挥重要作用,而此时获得性免疫受到了抑制。
关 键 词:溶藻弧菌 头肾 转录组 免疫应答 大黄鱼
分 类 号:S941.4]
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