文献类型：期刊文章

作　　者：陈模舜[1] 杨仲毅[1]

CHEN Moshun;YANG Zhongyi(School of Life Sciences,Taizhou University,Zhejiang Provincial Key Laboratory of Plant Evolutionary Ecology and Conservation,Taizhou 318000,Zhejiang,China)

机构地区：[1]台州学院生命科学学院,浙江省植物进化生态学与保护重点实验室,浙江台州318000

出　　处：《广西植物》

基　　金：浙江省基础公益研究计划项目(LY19C060001)。

年　　份：2022

卷　　号：42

期　　号：10

起止页码：1703-1716

语　　种：中文

收录情况：AJ、BDHX、BDHX2020、CAB、CAS、CSCD、CSCD_E2021_2022、IC、JST、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：天台鹅耳枥为中国特有的濒危植物,仅间断分布于浙江省境内,种群数量稀少,已处于极危状态。该文通过对6个自然居群(包含所有居群的母株)叶绿体基因组(cpDNA)单核苷酸多态性(SNP)研究,探讨天台鹅耳枥谱系结构与系统分化,以评估濒危状况,并提出相应的保护策略。使用TIANGEN试剂盒法提取基因组DNA,用Illumina NovaSeq 6000进行高通量测序,对获得叶绿体全基因组序列,使用在线程序OGDRAW制作cpDNA图谱,用DnaSP分析核苷酸多样性,用PopART软件进行单倍型网络构建,使用RAxML软件构建极大似然树(ML tree),用MrBayes构建Bayes tree。结果表明:(1)通过天台鹅耳枥叶绿体全基因组序列分析,发现大多数蛋白质编码基因和氨基酸序列显示出明显的密码子偏好,检测到cpLTR正向重复32个、回文重复25个、反转重复22个;SSR重复序列不同类型87个,其中大多数富含A/T,单核苷酸的数量最多。(2)在cpDNA中鉴定了314条SNPs,单核苷酸取代显示天台鹅耳枥群体属单系,分为天台县居群(THS)和景宁县居群(JST),居群单倍型之间演化关系呈现星状中心辐射。(3)所有居群核苷酸多样性的变异均较低(P_(i)<0.005),JST居群和THS居群单倍型多样性较低(H_(d)为0.5~0.6),显示出天台鹅耳枥在历史上遇到瓶颈后曾发生局部扩张,居群间呈现较大的遗传分化,居群内具有较低的遗传变异与居群间较高的分化水平。通过对cpDNA SNP的研究,揭示天台鹅耳枥的遗传多样性和谱系分化,为濒危植物天台鹅耳枥种质资源保护和遗传拯救提供理论依据。

关 键 词：天台鹅耳枥  叶绿体基因组 单核苷酸多态性 谱系结构  系统发育

分 类 号：Q943[植物生产类]