文献类型：期刊文章

作　　者：陆进[1,2] 安韶光[3] 马俊杰[3] 俞鹏[1] 陶恒[1] 陈云帆[1] 张浩轩[1,2]

LU Jin(Department of Human Anatomy,Bengbu Medical College,Bengbu 233000,China)

机构地区：[1]蚌埠医学院人体解剖学教研室 [2]蚌埠医学院数字医学与智慧健康安徽省重点实验室 [3]蚌埠医学院临床医学院,安徽蚌埠233030

出　　处：《牡丹江医学院学报》

基　　金：安徽省教育厅自然科学研究重点项目(KJ2019A0338);教育部产学合作协同育人项目(202101160001)。

年　　份：2022

卷　　号：43

期　　号：5

起止页码：27-34

语　　种：中文

收录情况：JST、普通刊

摘　　要：目的利用生物信息学方法,分析hsa-miR-106b-5p调控ESR1在肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)中的表达及其生存预后意义。方法利用BART和StarBase数据库筛选GSE108724芯片的差异miRNAs及其与HCC患者生存预后的关系;利用TargetScan和MetaScape数据库分析miRNAs的靶基因及其GO和KEGG富集分析,并利用String数据库和Cytoscape软件筛选靶基因中的HUB基因;对HUB基因进行生存预后分析及其与miRNAs的结合位点分析;通过临床数据构建HUB基因在HCC中的风险预测模型,并利用C-index、校准曲线(CC)、决策曲线分析(DCA)以及ROC曲线对预测模型进行评价。结果共得到5个差异miRNAs,仅hsa-miR-106b-5p对HCC患者生存预后有显著意义;hsa-miR-106b-5p的靶基因有644个,其KEGG主要富集在Rap1信号通路、MAPK信号通路和癌症信号通路上;GO功能主要富集在跨膜受体蛋白酪氨酸激酶、Ras GTPase结合和分解代谢调控等上;HUB基因中仅ESR1在HCC中低表达,并对HCC患者的生存预后有显著意义,且ESR1 mRNA 3’UTR直接与hsa-miR-106b-5p结合;Logistic回归分析发现低表达的ESR1是HCC患者生存预后的独立危险因素;且所构建的风险预测模型具有较好的准确性和有效性。结论hsa-miR-106b-5p调控ESR1使其在HCC中低表达,且不利于HCC患者的生存预后,可作为HCC的潜在治疗靶点。

关 键 词：生物信息学 肝细胞癌 基因 肿瘤

分 类 号：R735.5]