期刊文章详细信息
基于基因组与蛋白组分析挖掘高效杀虫菌株Bt S2480-1毒蛋白基因
Exploration of insecticidal genes in Bt S2480-1: based on the analysis of genome and proteome
文献类型:期刊文章
ZHOU Yan;YANG Tianbao;PAN Ganlin;MO Shidong;LIU Chuanshun;FANG Xuanjun;JIANG Mingguo(Guangxi Key Laboratory for Polysaccharide Materials and Modifications,School of Marine Sciences and Biotechnology,Guangxi Minzu University,Nanning 530008,Guangxi,China;Institute of Life Science,Jiyang College,Zhejiang A&F University,Zhuji 311800,Zhejiang,China;Hainan Institute of Tropical Agricultural Resources,Sanya 572025,Hainan,China)
机构地区:[1]广西民族大学海洋与生物技术学院,广西多糖材料与改性重点实验室,广西南宁530008 [2]浙江农林大学暨阳学院生命科学研究所,浙江诸暨311800 [3]海南省热带农业资源开发利用研究所,海南三亚572025
基 金:广西民族大学2020年度校级引进人才科研启动项目(2020KJQD23);广西科技重大专项(桂科AA18242026);2022年度广西高校中青年教师基础能力提升项目(2022KY0159)。
年 份:2022
卷 号:62
期 号:9
起止页码:3587-3596
语 种:中文
收录情况:AJ、BDHX、BDHX2020、CAS、CSCD、CSCD2021_2022、IC、JST、PUBMED、RCCSE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、核心刊
摘 要:【目的】鉴定苏云金芽孢杆菌野生型菌株Bt S2480-1的杀虫活性并挖掘该菌株含有的杀虫基因资源。【方法】采用Illumina Hiseq2000测序平台对Bt S2480-1菌株进行全基因组测序,通过生物信息学方法获得该菌株的基因组信息、基因预测以及毒蛋白基因预测识别;随后,利用LTQ-Obitrap nano-LC-MS/MS系统对该菌株的总蛋白进行了质谱分析;最后以致倦库蚊幼虫和甜菜夜蛾幼虫为靶标昆虫对该菌株进行了生物活性测定。【结果】Bt S2480-1基因组大小为6.2 Mb,GC含量为35.11%,拼接得到1个拟核和3个大质粒的可视化草图,预测编码基因6297个,其中含有12个预测毒蛋白基因。BtS2480-1菌株总蛋白在LTQ-OrbitrapMS/MS质谱分析中共有1 500个蛋白质获得鉴定,鉴定获得11个毒蛋白。Bt S2480-1菌株总蛋白对致倦库蚊幼虫表现出非常高的杀蚊活性,而对甜菜夜蛾幼虫杀虫活性相对偏弱,其LC50分别为27.636μg/m L (95%FL:12.559-61.707μg/m L)和496.833μg/mg (95%FL:320.134–776.964μg/mg)。【结论】Bt S2480-1菌株基因组分析显示共含有12个预测毒蛋白基因,LTQ-Orbitrap MS/MS鉴定获得11个毒蛋白,Bt S2480-1菌株总蛋白对致倦库蚊和甜菜夜蛾幼虫都具有杀虫活性。
关 键 词:苏云金芽孢杆菌 Bt S2480-1 毒蛋白 LTQ-Obitrap 杀虫活性
分 类 号:S476]
参考文献:
正在载入数据...
二级参考文献:
正在载入数据...
耦合文献:
正在载入数据...
引证文献:
正在载入数据...
二级引证文献:
正在载入数据...
同被引文献:
正在载入数据...