文献类型：期刊文章

作　　者：成小蓉[1] 姜军[1] 吴大珍[1] 莫连芹[1] 黄栋[1]

Cheng Xiaorong;Jiang Jun;Wu Dazhen;Mo Lianqin;Huang Dong(Department of Pediatric Intensive Care Medicine,Affiliated People′s Hospital of Guizhou Medical University,Guizhou Provincial People′s Hospital,Guiyang 550002,China)

机构地区：[1]贵州医科大学附属人民医院贵州省人民医院儿童重症医学科,贵阳550002

出　　处：《中国医药》

基　　金：贵州省科技计划(黔科合基础-ZK[2021]一般369)。

年　　份：2022

卷　　号：17

期　　号：9

起止页码：1352-1355

语　　种：中文

收录情况：JST、RCCSE、ZGKJHX、普通刊

摘　　要：目的筛选小鼠支气管肺发育不良(BPD)相关的潜在关键基因。方法从基因表达综合(GEO)数据库中获取BPD小鼠GSE25286和GSE29632数据集,筛选出2个数据集中共同的差异基因。通过基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析上述差异基因的生物学作用。利用STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用网络(PPI),利用Cytoscape3.7.2的CytoHubba插件筛选PPI网络中关键基因,再利用clusterProfiler包的关键基因进行GO和KEGG分析。结果GSE25286和GSE29632数据集中共筛选出45个共同差异基因。GO富集分析表明差异基因主要富集于受体配体活性、细胞因子活性、生长因子活性、趋化因子活性、受体复合物、质膜受体复合体等,KEGG结果显示差异基因主要富集于细胞因子受体相互作用、磷脂酰肌醇-3-激酶/蛋白激酶B信号通路、肿瘤坏死因子信号通路、p53信号通路、缺氧诱导因子1信号通路等。在PPI网络中筛选出7个关键基因:分别为早期生长反应1、细胞周期蛋白依赖性激酶抑制因子1A、丝氨酸蛋白酶抑制因子1、生长分化因子15、细胞因子信号传导抑制因子3、血小板反应蛋白1、抑瘤素M受体基因。结论BPD的生物信息学分析可发现相关潜在关键基因,可能为探索BPD潜在发病机制和治疗靶点提供理论依据。

关 键 词：支气管肺发育不良 生物信息学 差异基因 基因表达综合数据库  

分 类 号：R655.3]