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DNA条形码在黄精属药用植物鉴定与遗传多样性分析中的应用
Application of DNA barcodes in identification and genetic diversity analysis of medicinal plants of the genus Polygonatum
文献类型:期刊文章
Long Bing-Hong;Jiang Xiang-Hui;Song Rong;Li Sheng-Hua;Xiao Long-Qian;Yi Zi-Li;She Chao-Wen(College of Bioscience and Biotechnology,Hunan Agricultural University,Changsha 410128,China;Key Laboratory of Research and Utilization of Ethnomedicinal Plant Resources of Hunan Province,Huaihua University,Huaihua,Hunan 418000,China;College of Life Sciences and Chemistry,Hunan University of Technology,Zhuzhou,Hunan 412007,China;Institute of Agricultural Environment and Ecology,Hunan Academy of Agricultural Sciences,Changsha 410125,China)
机构地区:[1]湖南农业大学生物科学技术学院,长沙410128 [2]怀化学院民族药用植物资源研究与利用湖南省重点实验室,湖南怀化418000 [3]湖南工业大学生命科学与化学学院,湖南株洲412007 [4]湖南省农业科学院农业环境生态研究所,长沙410125
基 金:湖南省自然科学基金(2019JJ40231)。
年 份:2022
卷 号:40
期 号:4
起止页码:533-543
语 种:中文
收录情况:AJ、BDHX、BDHX2020、CAB、CAS、CSCD、CSCD2021_2022、IC、JST、RCCSE、WOS、ZGKJHX、核心刊
摘 要:黄精属(Polygonatum)的许多物种具有重要的药用价值,但目前缺乏能够准确、高效地鉴定黄精属药用植物的DNA条形码。本研究通过对ITS、trnK-matK、rbcL、psbA-trnH和psbK-psbI序列进行扩增和测序,并从ITS序列中提取ITS2序列,共获得黄精属7个药用物种23份样品的138条序列。进一步比较6个DNA条形码对黄精属药用植物的鉴定效率,并验证所筛选条形码的可靠性。结果显示:trnK-matK的种内和种间变异重合少且有较明显的条形码间隙,其他5个序列的种内和种间变异重合多且无条形码间隙;BLAST结果表明trnK-matK的鉴定效率最高(85.7%),系统发育树显示trnK-matK的鉴定能力最强,能将全部12个多花黄精样品聚在一支,并能区分黄精、滇黄精、玉竹、点花黄精和湖北黄精;AMOVA分析结果揭示trnK-matK的群体遗传分化指数(F_(st))最高,适用于区分黄精属物种间差异。因此,trnK-matK最适用于黄精属药用植物的分子鉴定。
关 键 词:黄精属 DNA条形码 遗传多样性 ITS MATK RBCL PSBA-TRNH psbK-psbI
分 类 号:R282.5[中药学类]
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