文献类型：期刊文章

作　　者：刘玲[1] 李璟[2] 范蕾[2] 宣焱[1] 杜淼[1] 张德玖[3] 李卓禧[2] 陈晓聪[2] 杨娅男[1] 徐本锦[1]

LIU Ling;LI Jing;FAN Lei;XUAN Yan;DU Miao;ZHANG De-jiu;LI Zhuo-xi;CHEN Xiao-cong;YANG Ya-nan;XU Ben-jin(Department of Medical Laboratory,Fenyang College of Shanxi Medical University,Fenyang 032200,China;Department of Basic Medicine,Fenyang College of Shanxi Medical University,Fenyang 032200,China;Institute for Translational Medicine,Qingdao University,Qingdao 266021,China)

机构地区：[1]山西医科大学汾阳学院医学检验系,汾阳032200 [2]山西医科大学汾阳学院基础医学部,汾阳032200 [3]青岛大学转化医学研究院,青岛266021

出　　处：《中国人兽共患病学报》

基　　金：山西省基础研究计划(自由探索类)项目(No.20210302123397);国家级大学生创新创业训练计划项目(No.202117114001);山西省高等学校大学生创新创业训练计划重点项目(No.S202117114008);山西省高等学校科技创新项目(No.2020L0749);山西医科大学汾阳学院引进人才科研启动金项目(No.2020A01);吕梁市科技计划项目(No.2020SHFZ29);国家自然科学基金项目(No.31870816)联合资助。

年　　份：2022

卷　　号：38

期　　号：7

起止页码：566-576

语　　种：中文

收录情况：AJ、BDHX、BDHX2020、CAB、CAS、CSCD、CSCD2021_2022、IC、JST、RCCSE、WOS、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：目的Nsp1是新冠病毒的主要毒力因子,介导了病毒在宿主细胞中的免疫逃逸,扩大了病毒感染范围。本研究对Nsp1进行系统生信分析及原核表达,有助于全面理解该蛋白在新冠病毒侵染宿主细胞中的分子机理。方法采用Pfam、TMHMM、ProtScale、ExPASy和SignalP 4.0等工具对Nsp1的翻译后修饰、理化性质、跨膜螺旋、相互作用网络、同源性及进化特点等进行系统分析;利用分子克隆技术构建重组表达载体pET-22b-Nsp1并进行原核表达。结果Nsp1由180个氨基酸组成,分子量19.78 kDa,等电点为5.36,不稳定指数28.83,在哺乳动物中的半衰期约30 h,在大肠杆菌内超过10 h,有12个可能的磷酸化位点和3个O-糖基化位点,无信号肽和跨膜螺旋,亲水性较强;二级结构分析显示,Nsp1中无规则卷曲占比最高(45.00%),其次是α螺旋(25.56%)和延伸链(20.56%),β-转角占比最低(8.89%);序列对比和进化分析显示,与SARS-CoV-2 Nsp1序列一致性最高的是蝙蝠非典型冠状病毒WIV1(85.0%);原核表达发现Nsp1主要在沉淀中表达,经质谱鉴定目的蛋白就是Nsp1。结论本研究为新冠病毒Nsp1的表达、纯化及功能分析提供了重要借鉴,有助于进一步揭示Nsp1的生物学功能及开展相关抑制剂和抗病毒药物的研发。

关 键 词：新冠病毒  Nsp1蛋白  生信分析  结构与功能  进化分析

分 类 号：R373.1]