文献类型：期刊文章

作　　者：赵容[1] 尹舒悦[2] 姜诚淏[1] 薛嘉宁[1] 刘畅[1] 蔡欣航[1] 邢艳萍[1] 康廷国[1]

ZHAO Rong;YIN Shu-yue;JIANG Cheng-hao;XUE Jia-ning;LIU Chang;CAI Xin-hang;XING Yan-ping;KANG Ting-guo(Liaoning University of Traditional Chinese Medicine,Dalian 116600,China;School of Mathematics and Statistics,Beijing Institute of Technology,Beijing 100081,China)

机构地区：[1]辽宁中医药大学,辽宁大连116600 [2]北京理工大学数学与统计学院,北京100081

出　　处：《中国中药杂志》

基　　金：辽宁省卫生健康委员会项目(2018004,2019004);中央本级重大增减支项目(2060302)。

年　　份：2022

卷　　号：47

期　　号：11

起止页码：2932-2937

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2020、CAB、CAS、CSCD、CSCD2021_2022、EAPJ、EMBASE、IC、JST、PUBMED、RCCSE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：该研究对汉城细辛Asarum sieboldii f.seoulense的叶绿体基因组进行测序分析并与GenBank下载的马兜铃科植物叶绿体基因组结构特征进行比较,旨在明确汉城细辛叶绿体基因组特征及马兜铃科药用植物叶绿体基因组的差异性。采用高通量测序技术对汉城细辛叶绿体基因组进行测序、组装,利用REPuter等软件对11种马兜铃科药用植物叶绿体基因组的一般特征,重复序列、IR边界以及进化关系进行分析。研究结果表明汉城细辛基因组大小为167 293 bp, LSC(large single-copy)为89 840 bp, SSC(small single-copy)为21 415 bp, IR(inverted repeat)为28 019 bp, GC量为37.9%,注释到133个基因,其中包括89个蛋白编码基因,36个tRNA基因和8个rRNA基因。11种马兜铃科植物的叶绿体基因组长度为159 308~167 293 bp,基因数为130~134个。其中5种药用植物叶绿体基因组中均发现了P、F、R、C 4种类型的长重复序列和具有SSR序列位点,其中汉城细辛具有6种类型的SSR序列,系统发育树中汉城细辛和辽细辛聚为1支。研究将为马兜铃科药用植物的分类鉴定及系统发育等相关研究提供基础。

关 键 词：马兜铃科 汉城细辛  叶绿体基因组 重复序列  

分 类 号：S567]