登录    注册    忘记密码

期刊文章详细信息

CC趋化因子配体20在肝细胞癌组织中的表达及其在肝细胞肝癌预后评估中作用的生物信息学分析    

Bioinformatics analysis on CC chemokine ligand 20 expression in hepatocellular carcinoma tissue and its effect on prognostic assessment of liver hepatocellular carcinoma

  

文献类型:期刊文章

作  者:胡连涛[1,2] 邓文俊[1,2] 鹿士振[1,2] 孙跞[1,3] 李学斌[1,3] 黎楚豪[1,2] 王欣然[1,2] 张春斌[1,4] 李玥[1,2] 王伟群[1,2]

HU Liantao;DENG Wenjun;LU Shizhen;SUN Luo;LI Xuebing;LI Chuhao;WANG Xinran;ZHANG chunbing;LI Yue;WANG Weiqun(Department of Physiology,College of Basic Medical Sciences,Jiamusi University,Jiamusi 154007,China;Key Laboratory of Microbiology-Immune Regulatory Network and Related Diseases,Heilongjiang Province,Jiamusi 154007,China;Deparment of Immunology,First Affiliated Hospital,Jiamusi University,Jiamusi 154007,China;Medical Technology Teaching and Research Office/Translation Medical Testing and Applied Technology Collaboration Innovation Center,Zhangzhou Health Vocational College,Zhangzhou,363000,China)

机构地区:[1]佳木斯大学基础医学院生理学教研室,黑龙江佳木斯154007 [2]黑龙江省微生物-免疫调解网络与相关疾病重点实验室,黑龙江佳木斯154007 [3]佳木斯大学第一临床医学院免疫科,黑龙江佳木斯154007 [4]漳州卫生职业学院医学技术教研室/翻译医学检测与应用技术协作创新中心,福建漳州363000

出  处:《吉林大学学报(医学版)》

基  金:黑龙江省教育厅基本科研业务费人才培养项目(2019-KYYWF-1338)。

年  份:2022

卷  号:48

期  号:4

起止页码:1010-1017

语  种:中文

收录情况:BDHX、BDHX2020、CAS、CSCD、CSCD_E2021_2022、EMBASE、IC、JST、RCCSE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、核心刊

摘  要:目的:研究CC趋化因子配体20(CCL20)在肝细胞肝癌(LIHC)组织中的表达,并探讨其对LIHC患者预后的影响,阐述CCL20影响LIHC恶性行为的机制。方法:采用Rstudio(4.03)软件从癌症基因图谱(TCGA)和UCSC Xena平台获取LIHC患者癌组织和癌旁组织中CCL20 mRNA表达水平和临床数据,比较CCL20 mRNA在2种组织中的表达差异,并利用GEPIA联合GTEx数据对上述结果进行验证;采用Kaplan-Meier生存分析和Cox回归分析法分析CCL20 mRNA表达水平与LIHC患者预后的关系。通过Pearson相关分析对LIHC患者CCL20 mRNA表达水平与甲胎蛋白(AFP)水平的相关性进行分析,并通过受试者工作特征(ROC)曲线下面积(AUC)、诺谟图和校正曲线分析LIHC患者CCL20 mRNA表达水平与患者临床诊断和生存预测情况的相关性。采用TCGA数据库对LIHC患者癌组织中CCL20 mRNA的表达进行基因集富集分析(GSEA),分析CCL20 mRNA表达水平与DNA拷贝数突变和DNA甲基化水平的相关性。结果:与癌旁组织比较,LIHC患者癌组织中CCL20 mRNA表达水平明显升高(P<0.01);Kaplan-Meier生存分析,CCL20 mRNA低表达患者的预后明显优于CCL20 mRNA高表达患者(HR=1.789,P<0.01),且Cox单因素和多因素回归分析表明CCL20 mRNA表达水平为LIHC患者的独立预后因素(P<0.05);Pearson相关分析,LIHC患者癌组织中CCL20 mRNA表达水平与AFP水平呈正相关关系(P<0.01);CCL20 mRNA表达水平在LIHC患者临床诊断评估中具有一定的参考价值(AUC=0.69,P<0.01),且可有效预测LIHC患者生存率。GSEA分析,CCL20可通过趋化因子、NOD样受体(NLR)、过氧化物酶体增殖物激活受体(PPAR)和Toll样受体(TLR)等肿瘤相关信号通路参与LIHC细胞黏附、细胞因子与细胞因子受体相互作用和核糖体功能实施等过程。遗传学和表观遗传学分析,与正常二倍体组比较,拷贝数丢失组和拷贝数扩增组样本中CCL20 mRNA表达水平差异无统计学意义(P>0.05);与拷贝数丢失组比较,拷贝数扩增组�

关 键 词:CC趋化因子配体20  肝细胞肝癌 生物信息学 预后 临床诊断  

分 类 号:R735.7]

参考文献:

正在载入数据...

二级参考文献:

正在载入数据...

耦合文献:

正在载入数据...

引证文献:

正在载入数据...

二级引证文献:

正在载入数据...

同被引文献:

正在载入数据...

版权所有©重庆科技学院 重庆维普资讯有限公司 渝B2-20050021-7
 渝公网安备 50019002500408号 违法和不良信息举报中心