文献类型：期刊文章

作　　者：刘成功[1] 李壑[1] 韩子超[1] 苏婷婷[1] 张月洋[1] 张尧[1] 李忠晴[1] 王爱英[1] 祝建波[1]

LIU Chenggong;LI He;HAN Zichao;SU Tingting;ZHANG Yueyang;ZHANG Yao;LI Zhongqing;WANG Aiying;ZHU Jianbo(Key Laboratory of Agricultural Biotechnology,College of Life Sciences,Shihezi University,Shihezi 832061,China)

机构地区：[1]石河子大学生命科学学院农业生物技术重点实验室,新疆石河子832061

出　　处：《河南农业科学》

基　　金：新疆生产建设兵团重点项目(0155/KZ0118)。

年　　份：2022

卷　　号：51

期　　号：5

起止页码：108-116

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2020、CAB、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：蔗糖非发酵型蛋白激酶2(Sucrose non-fermenting-1-related protein kinase2,SnRK2)是一类具有丝氨酸/苏氨酸特定结构域的蛋白质磷酸化酶,在ABA信号介导和非生物胁迫应答方面起到重要作用。以甜瓜为研究对象,使用生物信息学分析方法,对甜瓜SnRK2基因家族进行鉴定及相关特征分析,包括构建系统发育进化树,以及基因理化性质、基因结构及保守结构域、染色体定位、共线性分析、基因的上游顺式作用元件及转录组数据热图分析等,为甜瓜SnRK2基因的功能分析和研究奠定一定的理论基础。结果表明,在甜瓜基因组中共鉴定出9个SnRK2基因家族成员。主要定位在细胞骨架中,以α-螺旋和不规则卷曲为主,分子质量为31.49~75.02 ku,等电点为4.42~6.21。其可分为3个亚族,分布在4条染色体上。启动子分析结果显示,在甜瓜SnRK2基因的调控序列中有多个植物激素和逆境胁迫相关响应元件。组织表达分析结果表明,有些甜瓜SnRK2基因在不同组织中呈组成型表达,有些基因则具有显著的组织特异性。

关 键 词：甜瓜 SnRK2基因家族  鉴定  系统进化分析 生物信息学

分 类 号：S652]