文献类型：期刊文章

作　　者：江洁[1] 赵林清[2] 穆敏[3] 王文洋[3] 徐瑾[4] 蔡亮[5] 谢正德[6] 朱贞[1] 张燕[1] 周杉杉[1] 冯意[1] 毛乃颖[1]

Jiang Jie;Zhao Linqing;Mu Min;Wang Wenyang;Xu Jin;Cai Liang;Xie Zhengde;Zhu Zhen;Zhang Yan;Zhou Shanshan;Feng Yi;Mao Naiying(NHC Key Laboratory of Medical Virology and Viral Diseases,WHO WPRO Regional Reference Laboratory of Measles and Rubella,Measles Laboratory in National Institute for Viral Disease Control and Prevention,Chinese Center for Disease Control and Prevention,Beijing 102206,China;Laboratory of Virology,Capital Institute of Pediatrics,Beijing 100020,China;Department of Immunology,School of Medicine,Anhui University of Science and Technology,Huainan 232001,China;Institute of Expanded Immunization Programme,Henan Center for Disease Control and Prevention,Zhengzhou 450016,China;Department of Microbiological Examination,Hunan Center for Disease Control and Prevention,Changsha 410005,China;Laboratory of Infection and Virology,Beijing Pediatric Research Institute,Beijing Children’s Hospital,Capital Medical University,Beijing 100045,China)

机构地区：[1]国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室世界卫生组织西太平洋地区麻疹/风疹参比实验室中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所麻疹室,北京102206 [2]首都儿科研究所病毒研究室,北京100020 [3]安徽理工大学医学院免疫学教研室,淮南232001 [4]河南省疾病预防控制中心免疫预防与规划所,郑州450016 [5]湖南省疾病预防控制中心微生物检验科,长沙410005 [6]首都医科大学附属北京儿童医院北京市儿科研究所感染与病毒研究室,北京100045

出　　处：《中华实验和临床病毒学杂志》

基　　金：国家科技重大专项课题(2018zx10713002);腺病毒等4种重要病毒病原学监测网络的建立和运转项目(ZDGW21-131031103000180005)。

年　　份：2022

卷　　号：36

期　　号：2

起止页码：141-149

语　　种：中文

收录情况：CAB、CAS、CSCD、CSCD_E2021_2022、JST、PUBMED、ZGKJHX、普通刊

摘　　要：目的基于血凝素-神经氨酸酶蛋白(hemagglutinin-neuraminidase,HN)基因分析我国流行人副流感病毒3型(human parainfluenza virus 3,HPIV3)的基因变异规律和进化特征。方法采用多重荧光PCR方法对2007—2020年5个省市(北京、浙江、安徽、河南、湖南)急性呼吸道感染病例的咽拭子标本进行常见病原体核酸筛查,对HPIV3阳性标本进行HN基因序列测定,与GenBank数据库的国外和我国10个省的HPIV3流行代表株HN基因序列进行比对,应用多种生物信息学方法开展分子进化分析。结果本研究期间从5个省市共获得49株HPIV3的HN基因序列,核苷酸同源性在96.6%~100%之间,其中48株为C3基因亚型,1株为C5基因亚型。系统进化分析显示,我国12个省市在2003—2020年间存在C1、C3和C5基因亚型的毒株共流行,毒株间核苷酸和氨基酸同源性分别为95.4%~99.8%和97.9%~100%,其中C3是我国的优势流行基因亚型,分属于C3a、C3b、C3c、C3e和C3f进化分支,以C3f的传播范围和流行时间最为广泛。对C3基因亚型的进化分析显示,其最近共同祖先形成时间(tMRCA)可追溯到1990年,有效群体规模在2002—2010年间逐渐扩张而后趋于平稳;C3各进化分支HPIV3的HN基因进化速率在3.69×10^(-4)~5.82×10^(-4)替换/位点/年之间;C3基因亚型毒株HN蛋白共享N308、N351、N485和N523潜在N-糖基化位点,选择压力以负向选择为主。结论C3基因亚型是我国的本土优势HPIV3流行型别,形成了广泛传播和持续流行态势,并在流行过程中形成多个进化分支共同循环。

关 键 词：人副流感病毒3型  血凝素-神经氨酸酶蛋白  基因特征 贝叶斯进化分析  

分 类 号：R373.13]