文献类型：期刊文章

作　　者：张文德[1] 赵浩东[1] 孙明会[1] 余岢骏[1] 郭意龙[1] 朱乐冉[1] 胡颖[1] 赵萧[1] 叶亚萍[1] 陈大福[1,2] 郭睿[1,2]

ZHANG Wen-De;ZHAO Hao-Dong;SUN Ming-Hui;YU Ke-Jun;GUO Yi-Long;ZHU Le-Ran;HU Ying;ZHAO Xiao;YE Ya-Ping;CHEN Da-Fu;GUO Rui(College of Animal Sciences(College of Bee Science),Fujian Agriculture and Forestry University,Fuzhou 350002,China;Apitherapy Research Institute, Fujian Agriculture and Forestry University, Fuzhou 350002, China)

机构地区：[1]福建农林大学动物科学学院(蜂学学院),福州350002 [2]福建农林大学蜂疗研究所,福州350002

出　　处：《昆虫学报》

基　　金：国家自然科学基金面上项目(32172792);财政部和农业农村部:国家现代农业产业技术体系(CARS-44-KXJ7);福建农林大学杰出青年科研人才项目(xjq201814);福建农林大学硕士生导师团队项目(郭睿);福建省病原真菌与真菌毒素重点实验室开放课题(郭睿);福建省大学生创新创业训练计划项目(202210389115,20221030389128)。

年　　份：2022

卷　　号：65

期　　号：6

起止页码：708-717

语　　种：中文

收录情况：AJ、BDHX、BDHX2020、CAB、CAS、CSCD、CSCD2021_2022、JST、RCCSE、WOS、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：【目的】丰富东方蜜蜂微孢子虫Nosema ceranae的微小RNA(microRNA,miRNA)信息,并为深入探究miRNA在病原孢子和病原侵染中的功能提供理论和实验依据。【方法】基于已获得的small RNA-seq数据,利用生物信息学软件对东方蜜蜂微孢子虫的纯净孢子中的miRNA进行鉴定和分析。采用茎环反转录PCR(stem-loop RT-PCR)检测已鉴定的miRNA的表达;通过分子克隆与Sanger测序验证miRNA的序列。使用TargetFinder软件预测这些miRNA的靶基因,并对靶基因进行数据库注释。根据miRNA与靶基因的靶向结合关系构建调控网络,再利用Cytoscape软件进行可视化。【结果】在东方蜜蜂微孢子虫孢子中共鉴定到10个miRNA;这些miRNA的长度分布介于21~25 nt,首位碱基表现出U偏向性,每一位碱基的偏向性差异明显。Stem-loop RT-PCR检测结果表明这10个miRNA均真实表达;Sanger测序结果证实了随机选取的其中2个miRNA的序列真实性。共预测出249个靶基因,其中分别有249,118,136和3个靶基因可注释到Nr,Swiss-Prot,KOG和eggNOG数据库。此外,分别有134和71个靶基因可分别注释到GO数据库的30个功能条目和KEGG数据库的54条通路。【结论】本研究揭示了东方蜜蜂微孢子虫孢子中miRNA的存在和表达;这些miRNA通过调控潜在靶基因的表达参与孢子的生命活动。

关 键 词：蜜蜂 宿主 东方蜜蜂微孢子虫  小RNA测序  微小RNA 调控  

分 类 号：S895.3]