文献类型：期刊文章

作　　者：刘馨璥[1] 范苗苗[1] 赵奇[1] 毕佳欣[1] 宋洁[1]

LIU Xin-jing(Mudanjiang Medical University, Mudanjiang 157011, China)

机构地区：[1]牡丹江医学院基础医学院生物学教研室,黑龙江牡丹江157011

出　　处：《牡丹江医学院学报》

基　　金：牡丹江医学院研究生创新项目(YJSCX-MY20)。

年　　份：2022

卷　　号：43

期　　号：3

起止页码：60-63

语　　种：中文

收录情况：JST、普通刊

摘　　要：目的 筛选并分析乳腺癌的标志性枢纽基因。方法 从GEO数据库下载3个乳腺癌基因表达数据集,筛选乳腺癌中的差异表达基因,venn图取交集;Cytoscape构建PPI网络,获取TOP10枢纽基因;GO功能分析和KEGG通路分析枢纽基因的功能和通路。通过UALCAN和HPA数据库分析了mRNA和蛋白表达水平,通过Kaplan-Meier plotter数据库进行生存分析。QRT-PCR检测验证透明质酸介导的运动受体(Recombinant Hyaluronan Mediated Motility Receptor,HMMR)在乳腺癌细胞中的表达水平。结果 筛选到217个乳腺癌差异表达基因,确定了TOP10枢纽基因;GO功能分析和KEGG通路分析结果显示,TOP10枢纽基因与DNA复制、有丝分裂细胞周期的G1/S转变、有丝分裂细胞周期的G2/M转变相关,并且主要富集在p53信号通路上。经数据库验证,HMMR在乳腺癌中表达上调,并且与临床分期以及生存率负相关。QRT-PCR结果显示,与正常乳腺细胞MCF-10A相比,HMMR mRNA在乳腺癌细胞MCF-7、MDA-MB-231、SKBR3的表达水平明显上调(P<0.05)。结论 通过生物信息学方法筛选出参与乳腺癌发生发展的关键基因和功能通路,并鉴定HMMR是乳腺癌的主要生物标志物。

关 键 词：乳腺癌 枢纽基因  HMMR  生物标志物

分 类 号：R737.9]