文献类型：期刊文章

作　　者：史永林[1] 傅荔艳[2] 金晶[3] 葛盈露[1] 王鹏[1] 程鹏[4] 张文艳[3] 孙永[1]

Shi Yonglin;Fu Liyan;Jin Jing;Ge Yinglu;Wang Peng;Cheng Peng;Zhang Wenyan;Sun Yong(Key Laboratory for Medical and Health of Anhui Province,Microbiological Laboratory of Public Health Research Institute of Anhui Province,Anhui Provincial Center for Disease Control and Prevention,Hefei 230601,China;Department of Health Inspection and Quarantine,School of Public Health,Anhui Medical University,Hefei 230032,China;Microbiological Laboratory,Hefei Center for Disease Control and Prevention,Hefei 230061,China;Clinical Laboratory,Huangshan Center for Disease Control and Prevention,Huangshan 245000,China)

机构地区：[1]安徽省疾病预防控制中心安徽省公共卫生研究院微生物检验室,安徽省医疗卫生重点专科病原微生物分子生物学实验室,合肥230601 [2]安徽医科大学公共卫生学院卫生检验与检疫学系,合肥230032 [3]合肥市疾病预防控制中心微生物检验科,230061 [4]黄山市疾病预防控制中心检验科,245000

出　　处：《国际病毒学杂志》

基　　金：安徽省卫生计生委科研计划项目 (2017jk003)。

年　　份：2022

卷　　号：29

期　　号：2

起止页码：103-108

语　　种：中文

收录情况：JST、RCCSE、ZGKJHX、普通刊

摘　　要：目的了解安徽省急性胃肠炎疫情中GI组诺如病毒基因型别分布和进化特征。方法收集2020年5月至2021年4月急性胃肠炎聚集性疫情病例诺如病毒核酸阳性肛拭子标本,荧光定量PCR分型检测诺如病毒GI和GII基因组,采用RT-PCR扩增GI组诺如病毒聚合酶区(RNA-dependent RNA polymerase,RdRp)和VP1区部分基因片段并测序。运用诺如病毒在线分型工具鉴定基因型别,利用MEGA 6.0软件构建RdRp和VP1区基因系统进化树。结果45起疫情142份诺如病毒核酸阳性标本中检出23份为GI阳性,占19%(23/142);119份为GII阳性,占81%(119/142)。20份GI阳性标本PCR扩增产物测序成功。获取的20株诺如病毒RdRp-VP1区序列有6种分型,包括2株GI.1[P1]、2株GI.3[P10]、5株GI.3[P13]、2株GI.4[P4]、7株GI.5[P4]、2株GI.6[P11]。系统进化树显示:GI.1[P1]型安徽株与韩国株(MZ021974)、法国株(MK956173)同属一个进化分支;GI.3[P10]和GI.3[P13]型安徽株与中国台湾株(MN922742)、四川株(MW255366)、韩国株(MZ022026)进化距离较近;GI.4[P4]和GI.5[P4]型安徽株与2019年湖南株(MN938461)、2021年广东株(OK562729)处于一个进化分支;GI.6[P11]型安徽株独立为一个进化簇,与陕西株(MW243609)、日本株(LC646339)进化距离较近。结论安徽省急性胃肠炎GI组诺如病毒基因型分布呈多样性,有必要开展感染性腹泻疫情分子溯源监测。

关 键 词：诺如病毒 急性胃肠炎 基因型 进化特征

分 类 号：R512.5] R440[临床医学类]