文献类型：期刊文章

作　　者：陈娟[1] 蒋斌[2] 黄果[3] 贺秋冬[1]

CHEN Juan;JIANG Bin;HUANG Guo;HE Qiudong(Department of Radiotherapy,the Second Affiliated Hospital,Hengyang Medical School,University of South China,Hengyang,Hunan 421001,China;Department of Plastic Surgery,the Second Affiliated Hospital,Hengyang Medical School,University of South China,Hengyang,Hunan 421001,China;Cancer Research Institute,Hengyang Medical School of University of South China,Hengyang,Hunan 421001,China)

机构地区：[1]南华大学附属第二医院放疗科,湖南衡阳421001 [2]南华大学附属第二医院整形美容科,湖南衡阳421001 [3]南华大学衡阳医学院肿瘤研究所,湖南衡阳421001

出　　处：《中国普通外科杂志》

基　　金：湖南省科技厅临床医疗技术创新引导项目(2020SK51705);湖南省卫计委科研计划基金资助项目(B20180058)。

年　　份：2022

卷　　号：31

期　　号：5

起止页码：631-639

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2020、CAS、CSCD、CSCD_E2021_2022、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：背景与目的:乳腺癌是全球女性发病率最高的恶性肿瘤,化疗是乳腺癌最重要的治疗方式之一,最近的研究表明,化疗可能通过增强肿瘤微环境中的抗肿瘤免疫力来发挥抗肿瘤效应。因此,本研究通过生物信息学分析明确乳腺癌患者新辅助化疗(NAC)前后肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)及相关基因的变化,评估NAC对乳腺癌患者免疫影响。方法:GEO数据库输入“Breast Cancer”,“TAMs”,“Chemotherapy”进行检索,选择人乳腺癌组织的GSE134600数据集进行分析。通过R包(limma函数)筛选乳腺癌患者NAC前后组织样本中差异表达基因(DEGs)。对所有DEGs进行GO功能富集和KEGG通路分析。通过Cytoscape软件对DEGs进行蛋白互作网络可视化,并筛选关键核心基因,通过c Bio Portal对10个关键基因进行突变分析。使用R包(CIBERSORT)对GSE134600数据中的免疫细胞分布及相关性进行评估。结果:鉴定出751个乳腺癌NAC前后DEGs (409个上调基因和342个下调基因)。通过GO富集分析DEGs的生物过程(BP)、细胞组分(CC)和分子功能(MF)。在BP中主要富集在I型干扰素(IFN-I)信号通路/病毒应答与防御和病毒生命周期方面;在CC中主要富集在细胞膜的外在成分和细胞膜的细胞质侧方面;在MF中主要富集在细胞因子受体结合、双链RNA结合和脂肽结合方面。KEGG通路富集分析中,DEGs主要富集在甲型H1N1流感、麻疹、丙型肝炎、冠状病毒病COVID-19、NF-κB信号通路、EBV病毒感染、NOD样受体信号通路和阿米巴病信号通路。通过Cyto Hubba插件筛选出乳腺癌NAC前后TAMs相互作用程度最高的前10个关键基因:IFIT1、ISG15、MX1、MX2、IRF7、RSAD2、IFIT3、IFI35、IFI6、IFITM1。多组学分析发现IFIT1、MX1和MX2主要发生缺失突变,IFIT1主要发生基因深度删除,而MX1和MX2主要发生基因扩增。NAC后乳腺癌组织中M0巨噬细胞、CD8+T细胞及M2巨噬细胞含量减少,M0巨噬细胞与记忆性B细胞成正相

关 键 词：乳腺肿瘤 肿瘤相关巨噬细胞 免疫  计算生物学

分 类 号：R737.9]